FASTAやFASTQの塩基数をカウントする - macでインフォマティクス
- https://kazumaxneo.hatenablog.com
- entry
- 2018/02/20
- https://kazumaxneo.hatenablog.com
- entry
- 2018/02/20
2018/2/20 -FASTAファイルを引数にしてランする。 python fasta-stats.py input.fa > output. FASTAはgz圧縮でも読み込めます。また2つ以上も同時 ...
BLAST検索でヒットしたエントリ群のmulti fastaファイルを取得する
- https://togotv.dbcls.jp
- ...
- https://togotv.dbcls.jp
- ...
2007/9/26 -ここでは、BLAST検索の結果で得られた、問い合わせ配列と類似性のある配列群の配列をマルチファスタフォーマットで取得する方法について説明してい ...
getentry - DDBJ - 国立遺伝学研究所
- https://www.ddbj.nig.ac.jp
- services
- getentry
- https://www.ddbj.nig.ac.jp
- services
- getentry
検索結果の出力形式は,エントリに対して,各データベースで定められている形式か FASTA 形式 のいずれかを以下の選択肢からひとつ指定します。 DNAデータベース. 検索対象 ...
FASTA/FASTQ関係のツールまとめ - macでインフォマティクス
- https://kazumaxneo.hatenablog.com
- entry
- 2018/02/21
- https://kazumaxneo.hatenablog.com
- entry
- 2018/02/21
2018/2/21 -... fastaの操作ツール seqtk; BBtools 多機能なNGSの管理ツール BBtools; ATGCのカウント FASTAやFASTQの塩基数をカウント; Multi-fastaの分割 Mulit-FASTA ...
BLAST検索でヒットしたエントリ群のMulti FASTAファイルを取得する ...
- https://togotv.dbcls.jp
- ...
- https://togotv.dbcls.jp
- ...
2017/8/10 -BLAST検索の結果で得られた、問い合わせ配列と類似性のある配列群の配列をマルチファスタフォーマットで取得する方法について説明します。
FASTAファイル/FASTA形式とは - OlvTools
- https://olvtools.com
- documents
- fasta
- https://olvtools.com
- documents
- fasta
FASTAファイルとはFASTA形式で書かれたファイルで、塩基配列やアミノ酸配列を記述したファイルです。 ">"で始まる行には、配列の名前やID、説明等が記述されます。
【ファイル形式】FASTAとFASTQ - バイオインフォマティクス予備校
- https://bioinfosite.com
- NGS解析
- https://bioinfosite.com
- NGS解析
2024/3/25 -FASTAとFASTQはどちらもテキスト形式のファイルで、配列データを記載するのに用いられるファイル形式です。FASTA ... 数字や記号が並んでいると思います。
配列データベースのセットアップ
- https://www.matrixscience.co.jp
- supportpdf
- MA...
- https://www.matrixscience.co.jp
- supportpdf
- MA...
FASTA フォーマットの配列データベース・ファイルは上の例に示したエントリが複数. 個集合した形式になっています。Swiss-Prot データベース(部分)の FASTA ファイル. の ...
FASTA形式とは - Orbit Intelligence
- https://intelligence.help.questel.com
- solutions
- articles
- https://intelligence.help.questel.com
- solutions
- articles
FASTA形式は、ヌクレオチド配列またはアミノ酸(タンパク質)配列のいずれかを表すためのテキストベースの形式であり、ヌクレオチドまたはアミノ酸は1文字のコードを ...
FASTAとBLASTについて - DDBJ - 国立遺伝学研究所
- https://www.ddbj.nig.ac.jp
- activities
- homology-doc
- https://www.ddbj.nig.ac.jp
- activities
- homology-doc
NCBIでは、BLASTというFASTAのほぼ50倍速い、ホモロジー検索サービスが提供されます。これは、電子メールによるサーバーで、e-mailで検索配列を送るとe-mailで結果が ...