モチーフ検索

  1. https://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp
  2. ~shimizu
  3. bio
  4. motif
  1. https://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp
  2. ~shimizu
  3. bio
  4. motif

◎ ゲノムネットのデータベースで検索を行い、モチーフ検索を行うタンパク質のアミノ酸配列を取得します。 ① SwissProtで検索. 新しく作成したウィンドウからゲノム ...


配列モチーフを探す STREME - macでインフォマティクス - はてなブログ

  1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
  2. entry
  3. 2020/12/17
  1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
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  3. 2020/12/17

2020/12/17 -配列モチーフ発見アルゴリズムは、DNA、RNA、タンパク質の配列中で生物学的機能を果たす新規な配列パターン、例えば、DNAやRNA結合タンパク質の結合 ...


配列モチーフ解析 - ゲノム解析ツール リンク集 - Tool - NBDC

  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
  3. view
  4. stga_tool
  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
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モチーフ検索サーバー。 アミノ酸配列に関してはProfilefindによるプロファイル検索とHmmpfamによるHMM検索が可能である。DBとしてはPROSITE Pattern、Skip entries with ...


生物の研究に役立つデータベース - 生物情報工学研究室

  1. https://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp
  2. ~shimizu
  3. bio
  4. intro
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  2. ~shimizu
  3. bio
  4. intro

Entrezにより、文献情報検索システムMEDLINEとゲノム配列情報を結びつける検索が可能となる。 ... 塩基配列データベースは、DNA、RNAの塩基 ... こうしたモチーフを登録し、 ...


ゲノムネット - 計算ツール - GenomeNet

  1. https://www.genome.jp
  2. gn_tools_ja
  1. https://www.genome.jp
  2. gn_tools_ja

ゲノムネット計算ツール ; BLAST · FASTA, 配列類似性検索, Altschul et al. (1997) · Pearson and Lipman (1988) ; MOTIF, 配列モチーフ検索 ; CLUSTALW · MAFFT · PRRN


バイオインフォマティクス解析ツール リンク集

  1. http://genome.med.yokohama-cu.ac.jp
  2. biport
  1. http://genome.med.yokohama-cu.ac.jp
  2. biport

UI: ブラウザ. ENCODE. DNA機能ドメインのデータベース。ヒト、マウスのゲノムDNA上の機能ドメイン、修飾サイトを検索できる; 種類：データベース; UI: ブラウザ ...


DNA motif 検索に関連するBioconductor のパッケージ

  1. http://blog.hackingisbelieving.org
  2. dna-bioconductor
  1. http://blog.hackingisbelieving.org
  2. dna-bioconductor

2012/2/13 -MEMEっぽいアルゴリズムのモチーフ発見ツール。可視化も含む。GUIもあるらしい。 http://www.bioconductor.org/packages ...


課題5．モチーフ検索（MOTIF, Pfam）

  1. https://www.kanehisa.jp
  2. Japanese
  3. lect
  4. prob05
  1. https://www.kanehisa.jp
  2. Japanese
  3. lect
  4. prob05

ブラウザの別ウィンドウを開き、ゲノムネットのホームページから MOTIF ボタンをクリックして、MOTIF 検索ページを開く。 取得したアミノ酸配列をコピー＆ペーストする。


リピートモチーフ検索 - 北海道システム・サイエンス株式会社

  1. https://hssnet.co.jp
  2. ngs-application
  3. repeat-motif
  1. https://hssnet.co.jp
  2. ngs-application
  3. repeat-motif

次世代シーケンスデータを使用して、ゲノム上のリピートモチーフ（※マイクロサテライト、SSR、STR）を検索します。ゲノムサイズの大きな動植物でも、少量のリード ...


モチーフ抽出 - ゲノム解析ツール リンク集 - Tool - NBDC

  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
  3. view
  4. stga_tool
  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
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  4. stga_tool

ゲノム配列上の調節配列に関する解析サーバー。指定した遺伝子の上流配列を取得する機能、パターン抽出機能、パターン検索機能およびアノテーションの可視化機能を提供する ...