立体構造データベースと その利用 - 東京大学

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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. lectures
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2012/4/19 -– Sequence：アミノ酸配列、2次構造. – ... Chimera 1.5.2のアイコン. をダブルクリックし ... ChimeraでPDB IDを指定して表示せよ. 3. 全体像をpng形式で ...


分子可視化ソフト『Chimera』の使い方 2010 応用編 - TogoTV

  1. https://togotv.dbcls.jp
  2. ...
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2010/6/29 -ChimeraはPDBファイルなどのデータを元に生体高分子（主にタンパク質）の立体構造を3D画像で表示する分子可視化ソフトです。 今回の番組では、基本編 ...


UCSF ChimeraとModellerを用いた ホモロジー・モデリングと ...

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  1. https://pdbj.org
  2. cms-data
  3. workshop
  4. kawabata
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  1. https://pdbj.org
  2. cms-data
  3. workshop
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2015/6/13 -Chimera:標的配列のCa2+結合部位の推定. 鋳型立体構造(1ahr)のCa2+イオンの結合部位を求め、sequenceウィンドウで対応する標. 的配列の部位を確認すれば ...


UCHIMEでキメラ配列除去 #データ解析 - Qiita

  1. https://qiita.com
  2. データ解析
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2021/12/26 -シーケンスデータにはキメラ配列が入り込むことがあります。特に複数の生物種が含まれるメタゲノムデータではキメラ配列除去が必須です。


保存度による色分け(chimera編) - おうちでできる構造解析

  1. https://ouchidekaiseki.com
  2. consurf2
  1. https://ouchidekaiseki.com
  2. consurf2

Tools → Sequence → MultAlign Viewerからアライメントファイル(.aln)を開きます。 配列の選択; Structure → Associationsからpdbファイルに対応する配列を選択します。


UCSF Chimera Home Page

  1. https://www.cgl.ucsf.edu
  2. chimera
  1. https://www.cgl.ucsf.edu
  2. chimera

UCSF Chimera is a program for the interactive visualization and analysis of molecular structures and related data, including density maps, trajectories, ...


分子可視化ソフト『Chimera』の使い方 応用編 - TogoTV

  1. https://togotv.dbcls.jp
  2. ...
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2008/10/10 -入力した配列の多重配列アラインメント(MSA)と機械学習的なアプローチを組み合わせることで、原子レベルでの精密なタンパク質立体構造予測が可能になり ...


腸内フローラの構造解析：16S rDNA-クローンライブラリー法 - J-Stage

  1. https://www.jstage.jst.go.jp
  2. article
  3. jim
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キメラ配列とは，主に PCR増幅過程で伸長反応が不. 十分だった配列が次のサイクルで，別のバクテリア由来. の配列とアニールし，伸長反応を継続することで，前後. に異なる ...


Chimera Commands FrameSet

  1. https://www.cgl.ucsf.edu
  2. UsersGuide
  3. framecommand
  1. https://www.cgl.ucsf.edu
  2. UsersGuide
  3. framecommand

Chimera commands are listed below and in the Quick Reference (PDF). All commands can be truncated to unique strings, but their keywords cannot be truncated ...


【学部生向け】タンパク質ビューアUCSF Chimeraの使い方

  1. https://shiganai-kagaku.com
  2. tken
  3. ucsf_chimera
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2021/3/24 -この記事では、タンパク質の構造やアミノ酸配列を見ることができる、UCSF Chimeraというソフトの使い方をご紹介します。 日々の勉強でタンパク質の ...