ホモロジー検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で,進化・系統分類の解析,機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...
BLAST ☆ NCBI · DDBJ · GenomeNet. 他の方法に比べて桁違いに高速であるBLAST法はホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。
検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER
BLASTは、Basic Local Alignment Search Tool の略で、ペアワイズの局所的なアライメント/相同性検索(ホモ. ロジー検索)を比較的高速に行うプログラムのことを指します ...
NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
この方法は「相同性(ホモロジー)検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列(クエリー配列といいます)と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索できます ...
Q.アミノ酸配列の相同性に関する質問です。 2つのアミノ酸全体間でのホモロジー(%)を計算するのに良いソフトまたはサイトはないでしょうか? GENETYX ver.10のアミノ酸×アミノ酸ホモロジ...
A.たしかに。 GENETYXやBLASTは相同領域だけの計算ですね。 はい、これを解決しやすいのはalignment programです。 ExPASyの中の各サイトを試して見てはいかがでしょ...
A.核酸をmRNAと解釈しての回答です。 核酸のホモロジー検索と、タンパク質のホモロジー検索の大きな違いは 変異があったときに、それがタンパク質の変異になるかならないかの違いです。 既に理解して...
Q.同じ遺伝子を動物種間で比較するのがホモロジーですよね? 何%の相同性があるか知りたいんですが、Blastnでその数値は確認できますか? たとえば、トカゲなんかの遺伝子配列をマウスなどと比較すると...
A.>同じ遺伝子を動物種間で比較するのがホモロジーですよね? ホモロジー(似具合)の比較は同じ遺伝子である必要はなくて違う遺伝子との比較もあります。 同じ遺伝子(オーソログ)を比較すること...
日立中央研究所によって開発された高感度なホモロジー検索ツールである。 これらのツールは、動的に核酸配列をアミノ酸配列に変換して、厳密な動的プログラミング法に ...
生物情報学(バイオインフォマティクス)や、ゲノム科学などで使われる解析手法で、一定のアルゴリズムに基づき、異なる分子間のアミノ酸配列やヌクレオチド配列の類似性に ...
5.4 ホモロジー検索. 【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、. データベース中にあるかどうかを調べることである ...
ホモロジーサーチは検索者が指定したDNAや蛋白の配列に近いものをデータベースの中から捜し出すという作業です。配列がぴったし一致するなら、UNIXのgrepや宮沢さんの作っ ...