NCBI BLASTチュートリアル
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このチュートリアルでは、NCBIサイトでのBLASTによる相同性検索の方法について、一般的な使い方を紹介してい ... ホモロジー検索が可能です。 次に中央部の青四角で囲んだ ...
配列データベースとホモロジー検索
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データベース検索(ホモロジー検索). ホモロジー検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で,進化・系統分類の解析,機能解析などを目的とした.
BLASTクイックスタート
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このミニコースでは、配列相同性検索プログラムであるBLASTファミリについて実用的な紹介をしていきます。その課題は単純な探索から、ある特別な目的の探索をBLASTの ...
ホモログ及びオルソログタンパク質を検索するwebデータベース orthoFind
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- 2019/06/02
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2019/6/2 -ホモログを検索するとき、最初の選択は通常相同性検索のための標準的なツール、BLAST [ref.5]である。しかし、ホモログと見なされるすべての配列を収集し ...
2. アミノ酸配列解析
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NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
BLAST ☆ NCBI · DDBJ · GenomeNet. 他の方法に比べて桁違いに高速であるBLAST法はホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。
HomoloGeneを用いた相同な遺伝子の検索 | TogoTV
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2015/7/14 -NCBIが提供するHomoloGeneは、真核生物間の相同的な遺伝子を検索するツールです。種間比較や系統樹作成のために、興味のある相同遺伝子を一括で取得 ...
I.構造編-11.データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ
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この方法は「相同性(ホモロジー)検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列(クエリー配列といいます)と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
生物配列解析基礎
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2021/4/7 -相同性検索 (ホモロジー検索). ▫ 相同性検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を検索する. 方法で,進化・系統分類の解析,機能解析など ...
第5節 データベースおよびウェブツールを用いた バイオ ...
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5.4 ホモロジー検索. 【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、. データベース中にあるかどうかを調べることである。