Smith-Waterman法は データベース中のすべての配列との間で忠実にアラインメントを行なってホモロジースコアを算定する。BLASTやFASTAで見落とすような弱い類似性も拾える ...
配列データベースとホモロジー検索
- https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
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ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...
ホモロジーサーチ
- http://www.igs.cnrs-mrs.fr
- ogata2
- Paper
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ホモロジーサーチとはデータベースの中に自分が持っている配列と似ている配列がないかと検索することで，その結果， 運よく似た配列が見つかり，その配列の構造や機能 ...
ホモロジー検索 (by BLAST) - NBRC Culture Catalogue - NITE
- https://www.nite.go.jp
- HomologyDispSearchServlet
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検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER
NCBI BLASTチュートリアル
- https://www.jst.go.jp
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- blast-tutorial
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... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。
BLAST: Basic Local Alignment Search Tool
The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to ...
ホモロ. ジーサーチとは,問い合わせ配列とデータベースに蓄積. されたすべての配列を比較することによって,問い合わ. せ配列と類似性をもつ配列を検索することである.では.
ホモロジーサーチとは何？ わかりやすく解説 Weblio辞書
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- ホモロジーサーチ
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生物情報学（バイオインフォマティクス）や、ゲノム科学などで使われる解析手法で、一定のアルゴリズムに基づき、異なる分子間のアミノ酸配列やヌクレオチド配列の類似性に ...
BLASTとコンパチブルで高速なホモロジー検索ツール Diamond
- https://kazumaxneo.hatenablog.com
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- 2017/08/24
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2017/8/24 -BLASTとコンパチブルで高速なホモロジー検索ツール Diamond ... Diamondはindexのつけ方を工夫することでBLASTXの解析速度を加速できるツール。blastと同等 ...
FASTAとBLASTについて - DDBJ - 国立遺伝学研究所
- https://www.ddbj.nig.ac.jp
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ホモロジーサーチは検索者が指定したDNAや蛋白の配列に近いものをデータベースの中から捜し出すという作業です。配列がぴったし一致するなら、UNIXのgrepや宮沢さんの作っ ...