NCBI BLASTチュートリアル
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... BLAST検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です ...
配列データベースとホモロジー検索
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Lipman (1997),. "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= hsa:7100 TLR5 ...
BLAST: Basic Local Alignment Search Tool - NCBI
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The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to ...
Standard Protein BLAST-Nucleotide BLAST-Primer-BLAST-BLAST Help
BLASTクイックスタート
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その後、blastボタンを押してホモロジー検索を実行します。 しばらく待つと結果が表示されます。極めて多くのヒットが認められます。トップヒットのアライメントを見て ...
相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ
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最初に,相同性(homology)の概念について解説します。単に相同性と言っても,様々です。2本の配列を比較したときに,連続した5個のアミノ酸のみが完全 ...
2. アミノ酸配列解析
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2-1-1. Protein-protein BLAST (blastp) による検索. 前出のblastxが (塩基配列) 対 (アミノ酸配列) のホモロジー検索であったのに対し、blastpは (アミノ酸 ...
BLASTとコンパチブルで高速なホモロジー検索ツール Diamond
- https://kazumaxneo.hatenablog.com
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- 2017/08/24
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2017/8/24 -Diamondはindexのつけ方を工夫することでBLASTXの解析速度を加速できるツール。blastと同等の機能を持つが、論文ではblastより最大20000倍高速化 ...
FASTAとBLASTについて - DDBJ - 国立遺伝学研究所
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NCBIでは、BLASTというFASTAのほぼ50倍速い、ホモロジー検索サービスが提供されます。これは、電子メールによるサーバーで、e-mailで検索配列を送るとe-mailで結果が ...
BLASTによる検索
- http://isw3.naist.jp
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2009/11/26 -BLASTの出力では、指数表記で表されるので注意. ひとつの目安として、0.0001 = 10-‐4 より小さければホモロジーが有ると考える. 例えば、 10-‐4 は 1.0e ...
BLAST ☆ NCBI · DDBJ · GenomeNet. 他の方法に比べて桁違いに高速であるBLAST法はホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。
Q.ホモロジーモデリングに用いられるMODELLERプログラムについての質問です。 MODELLERプログラムはBLASTを用いていると書いてありましたが、 どのように用いているのでしょうか。 目...
解決済み-回答:2件-2015/12/30
Q.某大学でバイオテクノロジーについて学んでいます そこで質問なんですが、 ホモロジー検索について謝ってるものはどれかという問題で、 1.ホモロジーが高ければ、共通の祖先遺伝子に由来する可能性が高い 2
解決済み-回答:1件-2016/11/21