【Rosetta】超入門!フラグメントアセンブリによるタンパク質構造予測
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2022/12/26 -モンテカルロサンプリングによりフラグメントをアセンブルする戦略で、タンパク質の構造を予測する手法について紹介します。
【Rosetta】深層学習構造予測モデルtrRosettaの実態 - BioSpace
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2022/6/22 -trRosettaでは、入力情報としてマルチプル配列アライメントを使用し、全残基対の相対距離と方向の2種類を予測します。具体的には、相対距離dと、3個の二 ...
テンプレートなしのタンパク質構造予測手法〜CCMPredとRosettaを ...
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2018/12/3 -Rosettaはモンテカルロシミュレーション的なノリで構造をたくさん作り出します(とても雑な表現)。そして、「構造が収束する」というのは、下の図の左側 ...
AWS Batchを用いた大規模なタンパク質立体構造予測
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2022/3/11 -AlphaFold2 や RoseTTAFold など、複数の著名な研究チームがタンパク質構造予測に関するアルゴリズムを発表しています。彼らの研究は重要なものであり、 ...
高分子モデリング用ライブラリ群「Rosetta」のご紹介 - TEGAKARI
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Rosettaは、ワシントン大学のDavid Baker博士の研究室にてタンパク質の構造予測ツールとして始まりました。現在ではワシントン大学の枠を超え、 政府の研究所、研究機関、 ...
【構造生物学】タンパク質をコンピュータでデザイン ... - Udemy
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本講座ではRosettaの多岐にわたる機能の中から、De novo structure prediction(アミノ酸配列からのタンパク質構造予測)ができるようになることを最終目標に設定して、 ...
2022/11/1 -タンパク質を構成するアミノ酸配列からその安定な立体構造を予測することは、生命科学の研究において非常に重要な意味を持っている。
Rosettaとaccelerated MDシミュレーションで小さな ... - Qiita
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2020/10/2 -Rosettaとaccelerated MDシミュレーションで小さなタンパク質のde novo構造予測と構造精緻化を行う方法 · 背景 · 目的 · 計算環境 · 手順.
259: 人工設計タンパク質と市民科学(Designed Proteins and Citizen ...
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AlphaFold(アルファフォールド)、やRosetta(ロゼッタ)のようなタンパク質の折りたたみと設計を行うプログラムは、人工的に設計したタンパク質の構造を予測することが ...
タンパク質構造予測 - Wikipedia
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- タンパク質構造予測
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- タンパク質構造予測
専門的な言葉では「タンパク質の一次構造をもとに二次構造や三次構造を予測すること」と表現できる。構造予測は、逆問題であるタンパク質設計とは異なる。タンパク質の ...