配列データベースとホモロジー検索

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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. lectures
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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
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ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...


NCBI BLASTチュートリアル

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  1. https://www.jst.go.jp
  2. minicourses
  3. blast-tutorial
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  1. https://www.jst.go.jp
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  3. blast-tutorial

... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。


HomoloGeneを用いた相同な遺伝子の検索 | TogoTV

  1. https://togotv.dbcls.jp
  2. ...
  1. https://togotv.dbcls.jp
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2015/7/14 -NCBIが提供するHomoloGeneは、真核生物間の相同的な遺伝子を検索するツールです。種間比較や系統樹作成のために、興味のある相同遺伝子を一括で取得 ...


相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ

  1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
  2. activities
  3. blast-doc
  1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
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  3. blast-doc

DNAの塩基配列やタンパク質のアミノ酸配列の決定が一般的になった現在では，新たに決めた配列と相同性の高い配列をデータベース中で発見することが，分子の機能や ...


遺伝子解析ツール集：ホモロジーサーチ - 研究留学ネット

  1. http://www.kenkyuu.net
  2. genetool-03

... ホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。以前はギャップを考慮しなかったためアミノ酸配列のホモロジー検索ではFASTAを使う人も多かったが ...


BLAST: Basic Local Alignment Search Tool - NCBI

  1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov
  2. blast
  1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov
  2. blast

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to ...


2. アミノ酸配列解析

  1. https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
  2. bioinfo
  3. section_02
  1. https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
  2. bioinfo
  3. section_02

NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...


BLASTクイックスタート

  1. https://www.jst.go.jp
  2. nbdc
  3. bird
  4. minicourses
  5. blast
  1. https://www.jst.go.jp
  2. nbdc
  3. bird
  4. minicourses
  5. blast

このミニコースでは、配列相同性検索プログラムであるBLASTファミリについて実用的な紹介をしていきます。その課題は単純な探索から、ある特別な目的の探索をBLASTの ...


③配列を比較したいとき - 遺伝子配列の検索や比較に役立つwebツール ...

  1. https://guides.lib.kyushu-u.ac.jp
  2. alignment

2023/10/18 -取得した塩基配列(もしくはアミノ酸配列)と相同性のある配列（似た配列）を検索したいときによく使用されるのが、BLAST(Basic Local Alignment Sarch ...


生物配列解析基礎

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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. lectures
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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
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2021/4/7 -塩基配列 ＝ DNAの塩基（G A T C）の並び順. ▫ どのようにして，塩基配列を ... ホモロジー検索を用いて比較ゲノム解析を行いたい. Stand-alone BLASTを ...


DNA ホモロジー検索に関するQ&A（1件）

Yahoo!知恵袋

Q.来週、進級のかかったテストがあります。実習のテストなんですがどんな問題が出るか見当がつきません。生徒などに教えてる側の人にできればアドバイスもらいたいです。 実習の内容なんですが分子生物の実習で...

A.最低限押さえておくべき所だろうなぁ、と思う点をいくつか書いてみます。 ・DNA組み換えに必要な酵素とその動態、機構…制限酵素とか、DNAリガーゼとかがどう作用するか。 ・形質転換（トランスフォ...

解決済み-回答：1件-2007/10/20