NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
続いてアミノ酸配列同士の配列比較時の検索エンジンを設定しましょう。アミノ酸配列同士の比較では通常blastp. が用いられますが、よい弱いホモロジーを検索するために ...
データベース検索（ホモロジー検索）. ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした.
BLASTが登場するまではホモロジー検索の代名詞であったが、いまでは、使用頻度は低くなっている。しかし、いまでもアミノ酸配列のホモロジー検索には好んでFASTAを使って ...
tblastn クエリー配列がアミノ酸で、検索対象データベースが塩基配列の時に利用するプログラムである。検索する際に、核酸データベースは一度アミノ酸配列 ...
以上の操作で得られたラクトフェリンのアミノ酸配列データと似た配列を持つタンパク質が他にあるかどうかを検索してみます。この方法は「相同性（ホモロジー）検索」と ...
Q.アミノ酸配列の相同性に関する質問です。 2つのアミノ酸全体間でのホモロジー(%)を計算するのに良いソフトまたはサイトはないでしょうか？ GENETYX ver.10のアミノ酸×アミノ酸ホモロジ...
A.たしかに。 GENETYXやBLASTは相同領域だけの計算ですね。 はい、これを解決しやすいのはalignment programです。 ExPASyの中の各サイトを試して見てはいかがでしょうか。
ヒューリスティックなローカルアライメント法に基づいたホモロジー検索手法。核酸、アミノ酸配列いずれも受け付け、核酸、アミノ酸配列データベースへの探索を実施する。
blastp は、アミノ酸配列からなる入力配列と相同性を持つアミノ酸配列をデータベースから検索するプログラムである。blastp は塩基配列には対応しておらず、塩基配列に ...
tblastnではアミノ酸配列を入力とし、核酸データベースに対して検索が可能です。この際データベース側は6フレームすべてをアミノ酸に変換し、アミノ酸 vs アミノ酸の検索が ...
あなたの塩基配列を塩基配列データベースと比較します。 長大な塩基配列で相同性検索を行いたい場合，blastn より高速に検索結果が得られます。 blastn ...