配列データベースとホモロジー検索
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ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...
NCBI BLASTチュートリアル
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大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。 次に中央部の青四角で囲んだ部分が、 ...
... ホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。以前はギャップを考慮しなかったためアミノ酸配列のホモロジー検索ではFASTAを使う人も多かったが ...
2. アミノ酸配列解析
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NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
ホモロジーサーチ
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配列解析の基本的な手法であるホモロジーサーチがいかにして類似配列をデータベース中に検索するのか， 本稿ではその利用法も含めて紹介する． ... はじめに今から約 40 億年 ...
FASTAとBLASTについて - DDBJ - 国立遺伝学研究所
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ホモロジーサーチは検索者が指定したDNAや蛋白の配列に近いものをデータベースの中から捜し出すという作業です。 ... 検索結果は似たものの順に出てきて欲しいですから、 ...
ホモロ. ジーサーチとは,問い合わせ配列とデータベースに蓄積. されたすべての配列を比較することによって,問い合わ. せ配列と類似性をもつ配列を検索することである.では.
I．構造編-11．データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ
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この方法は「相同性（ホモロジー）検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列（クエリー配列といいます）と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
第5節 データベースおよびウェブツールを用いた バイオ ...
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【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、. データベース中にあるかどうかを調べることである。遺伝子 A と高い相同性 ...
生物配列解析基礎
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2021/4/7 -生物配列解析基礎. 相同性検索 （ホモロジー検索）. ▫ 相同性検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を検索する. 方法で，進化・系統分類の ...