- DNAホモロジーサーチ方法で検索しています。
- DNAホモロジサーチ方法で再検索
NCBI BLASTチュートリアル
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... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。
配列データベースとホモロジー検索
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ホモロジー検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で,進化・系統分類の解析,機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...
Smith-Waterman法は データベース中のすべての配列との間で忠実にアラインメントを行なってホモロジースコアを算定する。BLASTやFASTAで見落とすような弱い類似性も拾える ...
ホモロジーサーチ
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配列解析の基本的な手法であるホモロジーサーチがいかにして類似配列をデータベース中に検索するのか, 本稿ではその利用法も含めて紹介する. 【キーワード】 ゲノム計画 ...
ペアワイズ配列比較を用いたホモロジーサーチ. 一口にホモロジーサーチといっても,それらはデータ. ベース検索の方法や使われ方によっていくつかに分類で. きる.その一つ ...
FASTAとBLASTについて - DDBJ - 国立遺伝学研究所
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ホモロジーサーチは検索者が指定したDNAや蛋白の配列に近いものをデータベースの中から捜し出すという作業です。 ... 検索結果は似たものの順に出てきて欲しいですから、 ...
生物配列解析基礎
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2021/4/7 -塩基配列 = DNAの塩基(G A T C)の並び順 ... ▫ 他の方法に比べて高速であり,ホモロジー検索の方法として ... ホモロジー検索を用いて比較ゲノム解析を ...
2. アミノ酸配列解析
- https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
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NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ
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第5節 データベースおよびウェブツールを用いた バイオ ...
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ここでは、ホモロジー検索ツール『BLAST』を用. いて、植物における Urm1 のホモログ(相同性を示す遺伝子・タンパク質)の同定を試みる。 【イネにおける Urm1 ホモログ( ...