モチーフ検索

  1. https://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp
  2. ~shimizu
  3. bio
  4. motif
  1. https://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp
  2. ~shimizu
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  4. motif

HMMERはワシントン大学で開発されたHMM（Hidden Markov Model：隠れマルコフモデル）を利用して特徴の抽出と検索を行うシステムです。PVMやthreadを用いた並列処理に対応 ...


配列モチーフ探索 - Heavy Watal

  1. https://heavywatal.github.io
  2. bio
  3. motif
  1. https://heavywatal.github.io
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  3. motif

PSM: probabilistic sequence model · N 本の各配列のモチーフ位置の初期値をランダムに与える · ランダムに配列をひとつ選び、それ以外の配列のモチーフを並べてPWMを計算 ...


モチーフについて - J-Stage

  1. https://www.jstage.jst.go.jp
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  3. jjsai
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ホモロジー検索では配列ど. うしのマッチングを行い，動的プログラミング法など. により適当に「ギャップ」を挿入しながら，（照合す. る要素が多いという意味で）似ている ...


配列モチーフを探す STREME - macでインフォマティクス

  1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
  2. entry
  3. 2020/12/17
  1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
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  3. 2020/12/17

2020/12/17 -STREMEは、選択した停止基準を満たすまで、以下の5つのステップを繰り返してモチーフを検索する。停止基準は、モチーフの統計的有意性（p値）、または ...


課題5．モチーフ検索（MOTIF, Pfam）

  1. https://www.kanehisa.jp
  2. Japanese
  3. lect
  4. prob05
  1. https://www.kanehisa.jp
  2. Japanese
  3. lect
  4. prob05

課題5．モチーフ検索（MOTIF, Pfam）. ヒトのアポトーシス関連遺伝子 BCL2 のアミノ酸配列中にどんなモチーフがあるか、MOTIF および Pfam で検索する。


配列モチーフ・隠れマルコフモデル

PDF
  1. http://goto.kuicr.kyoto-u.ac.jp
  2. lecture
  3. 5_motif
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  1. http://goto.kuicr.kyoto-u.ac.jp
  2. lecture
  3. 5_motif

隠れマルコフモデルによるプロファイル作成とモチーフ検索. ファミリー1 ... ホモロジー検索とモチーフ検索. 23. 配列データベース. モチーフ辞書. 知識獲得. 質問 ...


MOTIF: Searching Protein Sequence Motifs - GenomeNet

  1. https://www.genome.jp
  2. tools
  3. motif
  1. https://www.genome.jp
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  3. motif

MOTIF Search. Search Motif Library, Search Sequence Database · Generate Profile ... Sequence data. Select motif libraries : ( Help ). Databases, Cut-off score


Biosequence: モチーフ検索 - Orbit Intelligence

  1. https://intelligence.help.questel.com
  2. solutions
  3. articles
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配列をモチーフで検索できます。 CDR配列の基、特定のペプチドパターン、またはSNPの検索がこれまでになく簡単になりました。 Motif の書き方ルール.


モチーフ検索 - ゲノム解析ツール リンク集 - Tool - NBDC

  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
  3. view
  4. stga_tool
  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
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  4. stga_tool

ユーザの入力した塩基またはアミノ酸の配列パターンを、指定したデータベースより検索するツール。ユーザはパターンに対するミスマッチ、欠失、挿入の許容数を定義すること ...


2. アミノ酸配列解析

  1. https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
  2. bioinfo
  3. section_02
  1. https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
  2. bioinfo
  3. section_02

モチーフ、ドメイン検索. 上述したように、モチーフとはタンパク質中で局所的に非常に良く保存されているアミノ酸配列のことであり、多くは機能と対応づけられている。