(メタゲノム向け) blastアノテーション結果をインタラクティブなグラフで ...
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- 2019/06/26
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2019/6/29 -いくつかの方法は、単一のメタゲノムを視覚的に探索することを目的としているが、他の方法は、複数のメタゲノムの視覚化を可能にする。このツールには、円 ...
2021/10/5 -メタゲノム解析というと、その定義は環境中の微生物の全遺伝子を指すが、16S rRNA遺伝子の塩基配列のみを対象とした解析（メタ16S解析：英語では、16S ...
• 12Sまたは18S rRNAメタゲノム解析などの適用が可能 megablast. MLST. • バクテリアのMulti Locus Sequencing Typing （MLST） 解析が可能. • 全ゲノムとアンプリコン ...
メタゲノム解析
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2017/8/31 -遺伝子レベルで病原性のメカニズムがわかっている生物の場. 合、. • ある遺伝子を持っているか否か？ • ある遺伝子に一塩基置換があるか無いか？
メタゲノムのリアルタイム分類ツール LiveKraken
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- 2018/06/11
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2018/6/11 -fastqまたはfastaの入力からk-merの配列に分解し、構築したデータベースにアライメントを行う。BLASTと同等の精度を保ちながら、megablastより最大909倍 ...
メタゲノム解析
- https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
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2017/8/30 -遺伝子レベルで病原性のメカニズムがわかっている生物の場. 合、. • ある遺伝子を持っているか否か？ • ある遺伝子に一塩基置換があるか無いか？
2014/11/18 -メタゲノム解析，メタ 16S 解析の双方で解析の出発. 点は，サンプルからの DNA 抽出である．抽出方法は現. 時点ではスタンダードがなく，各研究グループで ...
研究成果の概要（和文）： 次世代シークエンサー（NGS）を用いて、胃腸炎事例のメタゲノム解析を行った。 ... （3）メタゲノム解析 ... ト遺伝子配列を除いて megablast 解析を ...
腸内細菌群集の網羅的代謝機能データベース - 生化学
- https://seikagaku.jbsoc.or.jp
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2023/8/25 -メタゲノム解析は環境中の微生物群集構造を明らかすることができるため，ヒト腸内環境解析だけではなく，土壌や海洋という環境サンプルに対しても同様の ...
2つの湖の微生物叢を比較する - フィルジェン
- https://filgen.jp
- OmicsBox_Webseminar_200420
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・OmicsBoxを使用したメタゲノム解析により、湖に生息する微生物群集を特定し、機能的な遺伝的潜在能力を測定することができました。 ・Preta湖とVerde湖の分類学的および ...