2. アミノ酸配列解析
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NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
配列データベースとホモロジー検索
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ホモロジー検索(相同性検索)とは? MIGMMIT. MMIGPIT. MDIGIT. MYLGPST. MMIQPMMDG ... これらと相同なアミノ酸配列がMgenitalium.faa内にあるか. どうかを調べるために ...
用語集
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ホモロジー (homology). 相同性をさす。同一性 (identity) は一致性をさす。例えばアミノ酸配列間のホモロジー (相同性) をいう場合、同じ性質を持つアミノ酸 ...
I.構造編-11.データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ
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この方法は「相同性(ホモロジー)検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列(クエリー配列といいます)と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
NCBI BLASTチュートリアル
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blastp. アミノ酸配列を問い合わせ配列として、アミノ酸配列データベースから相同性を持つ配列(エントリ)を検 ... ホモロジー検索が可能です。 次に中央部の青四角で囲んだ ...
相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ
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最初に,相同性(homology)の概念について解説します。単に相同性と言っても,様々です。2本の配列を比較したときに,連続した5個のアミノ酸のみが完全に一致して ...
ホモロジーモデリング:バイオキーワード集 - 羊土社
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構造予測を行うタンパク質のアミノ酸配列を,立体構造データベースのアミノ酸配列に対してホモロジー検索を行い,もし立体構造既知のタンパク質と有意な配列ホモロジー ...
ホモロジー・モデリングの基礎と複 合体立体構造の検索・モデリング
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2015/2/20 -原理 : 立体構造はアミノ酸配列より保存しやすい. 立体構造データベースの中から、クエリ配列に. 最も適合する構造(テンプレート構造)を探す.
... ホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。以前はギャップを考慮しなかったためアミノ酸配列のホモロジー検索ではFASTAを使う人も多かったが ...
分子機能研究所|ホモロジーモデリング
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一般に、アミノ酸側鎖配座(ロータマー)は鋳型として用いたタンパクの側鎖ロータマーにあわせます(ロータマー最適化を参照)。 使用モジュールプログラム:Homology ...
Q.アミノ酸配列の相同性に関する質問です。 2つのアミノ酸全体間でのホモロジー(%)を計算するのに良いソフトまたはサイトはないでしょうか? GENETYX ver.10のアミノ酸×アミノ酸ホモロジ...
解決済み-回答:1件-2013/9/3
Q.ホモロジーモデリングに用いられるMODELLERプログラムについての質問です。 MODELLERプログラムはBLASTを用いていると書いてありましたが、 どのように用いているのでしょうか。 目...
解決済み-回答:2件-2015/12/30
解決済み-回答:2件-2011/2/13