NCBI BLASTチュートリアル

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  1. https://www.jst.go.jp
  2. minicourses
  3. blast-tutorial
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  1. https://www.jst.go.jp
  2. minicourses
  3. blast-tutorial

BLASTは、Basic Local Alignment Search Tool の略で、ペアワイズの局所的なアライメント／相同性検索（ホモ. ロジー検索）を比較的高速に行うプログラムのことを指し ...


NCBI BLASTの使い方 〜基本編〜 2017 | TogoTV

  1. https://togotv.dbcls.jp
  2. ...
  1. https://togotv.dbcls.jp
  2. ...

2017/3/21 -塩基配列を問い合わせ配列として、nr/ntデータベース（冗長性を排した塩基配列データベース）に対して検索を行い、機能を推定する使い方を説明します。


塩基配列データベースの現状とその有効活用方法

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  1. https://www.sbj.or.jp
  2. sbj
  3. 9503_bioinformatics
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  1. https://www.sbj.or.jp
  2. sbj
  3. 9503_bioinformatics

らのDBに登録して，その登録番号（accession number） ... ンとは注釈情報のことで，この場合はゲノム上のその位. 置 ... blast.ncbi.nlm.nih.gov/ (2016/11/29). 3) DDBJ ...


1.インターネットを用いた遺伝子検索法 | NCGM脂質シグナリング ...

  1. http://www.ncgmlipidsp.jp
  2. protocol
  1. http://www.ncgmlipidsp.jp
  2. protocol

BlastやFastaが塩基配列やアミノ酸配列からスタートするのに対して、キーワードや、Accession numberなどをもとに検索する場所です。検索できる主要なデータベースは以下の ...


NCBI BLAST+ を使って 自分のコンピュータでBLAST検索をする

  1. https://togotv.dbcls.jp
  2. ...
  1. https://togotv.dbcls.jp
  2. ...

2020/12/16 -NCBI BLAST(えぬしーびーあいブラストと発音します)は、問い合わせ配列に類似した配列をデータベース中から検索するツールです。BLASTの名称はBasic ...


国際塩基配列データベースのアクセッション番号 - DDBJ

  1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
  2. documents
  3. accessions
  1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
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  3. accessions

INSD (the International Nucleotide Sequence Databases; 国際塩基配列データベース) とは ... UniProt accession numbers: 例 P12345, Q01234. Related pages. 登録データ ...


NCBI 16s rRNAのBLAST DBを複数階級の情報をもつ形式に変換して ...

  1. https://edna-blog.com
  2. データの解析方法
  1. https://edna-blog.com
  2. データの解析方法

2023/6/20 -もう少し使いやすいように、NCBI Accession Numberをキーとして、SILVAなどで採用されている複数の分類階級を記載する形式に変換してみよう。というのが ...


2-1. 配列解析基礎

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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. 20140905_2-1_bono
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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. 20140905_2-1_bono

2014/8/4 -Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402 ...


accession number - 和訳 – Linguee辞書

  1. https://www.linguee.jp
  2. 翻訳
  3. accession+number
  1. https://www.linguee.jp
  2. 翻訳
  3. accession+number

塩基配列による BLAST サーチ」は、Clone ID や Accession ID、Gene Symbol、Gene ID が分から ないとき、関連するクローンを探すとき（例えば splice variants）、塩基 ...


Query Input and database selection — BlastTopics 0.1.1 documentation

  1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov
  2. BLAST
  3. fasta
  1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov
  2. BLAST
  3. fasta

BLAST accepts a number of different types of input and automatically determines the format or the input. To allow this feature there are certain conventions ...