Biomartを使い倒すマイクロアレイprobeIDの対応表を ...

  1. https://togotv.dbcls.jp
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2009/2/25 -... Biomartでは容易にできることも紹介しています。作成した表はAffymetrixとAgilentのマイクロアレイのプローブIDの対応表となります。 Related videos.


【R】遺伝子のIDを変換したり検索したい - いろいろ倉庫

  1. https://choron81.hatenablog.com
  2. entry
  3. 2023/06/05
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  3. 2023/06/05

2023/6/5 -filterには以下のような選択肢がある。今回は、AFFY HG U133A 2 probeのIDを意味が分かる遺伝子名などに変換したいので、filterはaffy_hg_u133a_2になる。


【R】 遺伝子ID/遺伝子名の変換方法 - Zenn

  1. https://zenn.dev
  2. rchiji
  3. articles
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2023/3/13 -bioMartのブラウザでは、Filtersの画面で「欲しい遺伝子の制限 (特定の染色体番号や、queryとする遺伝子一覧など)」を行う。 一方、Rで情報取得する際の ...


Can't match on some, but not all, Illumina probe IDs using biomaRt

  1. https://support.bioconductor.org
  2. ...
  1. https://support.bioconductor.org
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2015/12/11 -I'm using biomaRt to find the Ensembl transcripts detected by the Illumina ht-12 v4 probes. For roughly 1/4 of the probes the probe ID is not ...


biomaRt包定义biotype - RPubs

  1. https://rpubs.com
  2. ...
  1. https://rpubs.com
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2019/8/21 -biomaRt包注释芯片数据 · EntrezGene转GO 注释 · 获取特定GO及染色体的symbol名 · 获取感兴趣的GO term上的基因 · 鉴定出biotype类型 · 参考资料.


BioMart v0.9を使い倒す 〜遺伝子情報や配列を取得する〜 | TogoTV

  1. https://togotv.dbcls.jp
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2014/8/30 -既に解読が終了したゲノムプロジェクトを始め、現在進行中のゲノムプロジェクトやメタゲノムプロジェクトについて調べることができます。塩基配列や発表 ...


(Rで)マイクロアレイデータ解析

  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. ~kadota

biomaRtというRパッケージ(Durinck et al., Nat Protoc., 2009)を用いて、 各種アレイ上に搭載されているプローブセットに対応する転写物（トランスクリプトーム）配列を ...


Introduction to Bioconductor Annotation Resources(日本語訳) - RPubs

  1. https://rpubs.com
  2. kozo2
  3. AnnotationWorkshop
  1. https://rpubs.com
  2. kozo2
  3. AnnotationWorkshop

2020/9/9 -Be able to make queries using biomaRt : biomaRtを使用してクエリを作成できる ... プローブIDです. It's sometimes in the name ... 名から推測できます.


AnnotationWorkshop_Japanese.md - gists · GitHub

  1. https://gist.github.com
  2. kozo2
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  2. kozo2

Be able to make queries using biomaRt : biomaRtを使用してクエリを作成できる ... : ロードしたExpressionSet (eset) のプローブセット ... 名から推測できます. TxDb ...


大量のgene symolを一般名に変換するフリーソフトなど

  1. http://www.kenkyuu2.net
  2. biotechforum

2014/11/13 -biomartとか、そのあたりからGene symbolとGene nameのリストを出してきて、自分のSequenceデータをRやPerlやらそのあたりのソフトでMargeさせると良い、 ...