NCBI BLASTチュートリアル

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  1. https://www.jst.go.jp
  2. minicourses
  3. blast-tutorial
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大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。 次に中央部の青四角で囲んだ部分が、 ...


BLAST: Basic Local Alignment Search Tool - NCBI

  1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov
  2. blast
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  2. blast

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to ...

Standard Protein BLAST-Nucleotide BLAST-Primer-BLAST-BLAST Help


遺伝子解析ツール集：ホモロジーサーチ - 研究留学ネット

  1. http://www.kenkyuu.net
  2. genetool-03

BLASTが登場するまではホモロジー検索の代名詞であったが、いまでは、使用頻度は低くなっている。しかし、いまでもアミノ酸配列のホモロジー検索には好んでFASTAを使って ...


配列データベースとホモロジー検索

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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. lectures
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BLAST検索の際にE valueの閾値を設定することで，その値. よりも小さいE valueの検索結果しか出力されなくなります． 閾値を設定するには，-evalueオプションを用います．


ホモロジー検索 (by BLAST) - NBRC Culture Catalogue - NITE

  1. https://www.nite.go.jp
  2. HomologyDispSearchServlet
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  2. HomologyDispSearchServlet

検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER


相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ

  1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
  2. activities
  3. blast-doc
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ここでは，BLASTのプログラムの原理と実際の作業手順について，簡単に紹介します。 何を探すのか. 最初に，相同性（homology）の概念について解説します。単に相同性と ...


BLASTクイックスタート

  1. https://www.jst.go.jp
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  4. minicourses
  5. blast
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その後、blastボタンを押してホモロジー検索を実行します。 しばらく待つと結果が表示されます。極めて多くのヒットが認められます。トップヒットのアライメントを見て ...


2. アミノ酸配列解析

  1. https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
  2. bioinfo
  3. section_02
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  3. section_02

NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...


GENESEQ, PATGENE ファイル - ホモロジー検索 (BLAST, GETSIM ...

  1. https://www.jaici.or.jp
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2022/2/14 -GENESEQ ファイルは、世界 57 ヵ国の特許から抽出した核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです。


FASTAとBLASTについて - DDBJ - 国立遺伝学研究所

  1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
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  3. homology-doc
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NCBIでは、BLASTというFASTAのほぼ50倍速い、ホモロジー検索サービスが提供されます。これは、電子メールによるサーバーで、e-mailで検索配列を送るとe-mailで結果が ...