配列データベースとホモロジー検索
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ホモロジー検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で ... ホモロジー検索による比較ゲノム. Mpneumoniae.faaには,Mycoplasma pneumoniaeが ...
Smith-Waterman法は データベース中のすべての配列との間で忠実にアラインメントを行なってホモロジースコアを算定する。BLASTやFASTAで見落とすような弱い類似性も拾える ...
HomoloGeneを用いた相同な遺伝子の検索 | TogoTV
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2015/7/14 -NCBIが提供するHomoloGeneは、真核生物間の相同的な遺伝子を検索するツールです。種間比較や系統樹作成のために、興味のある相同遺伝子を一括で取得 ...
NCBI BLASTチュートリアル
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... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。
ホモログ及びオルソログタンパク質を検索するwebデータベース orthoFind
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- 2019/06/02
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2019/6/2 -ホモログを検索するとき、最初の選択は通常相同性検索のための標準的なツール、BLAST [ref.5]である。しかし、ホモログと見なされるすべての配列を収集し ...
第5節 データベースおよびウェブツールを用いた バイオ ...
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5.4 ホモロジー検索. 【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、. データベース中にあるかどうかを調べることである。
I.構造編-11.データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ
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この方法は「相同性(ホモロジー)検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列(クエリー配列といいます)と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
ホモロジーサーチ
- http://www.igs.cnrs-mrs.fr
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- Paper
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細胞内の DNA に蓄えられている全遺伝情報をゲノムという.1990 年代初頭から,ヒト,その他様々な生物の全ゲノムあるいは全遺伝子の塩基配列を決定するためのプロジェクト ...
ホモロジー検索 (by BLAST) - NBRC Culture Catalogue - NITE
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検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER
相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ
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BLASTでは,アミノ酸配列の比較の場合には,BLOSUM62というアミノ酸の間の相同性スコア行列を利用します。DNAの塩基配列の場合は,一致した塩基には+5,異なる塩基に ...