アミノ酸 ホモロジー検索 で検索した結果 1〜10件目 / 約22,800件 - 0.41秒
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- 2. アミノ酸配列解析
NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp > bioinfo > section_02 - バイオインフォマティクスの基礎実習(ホモロジー検索)
ホモロジー検索はこれとは異なり、上で述べたように、手持ちの塩基配列あるいはアミノ酸配列と関係がありそうな、よく類似した配列をデータベースに対して検索することに ...
https://lecture.ecc.u-tokyo.ac.jp > database > lec2 - NCBI BLASTチュートリアル
続いてアミノ酸配列同士の配列比較時の検索エンジンを設定しましょう。アミノ酸配列同士の比較では通常blastp. が用いられますが、よい弱いホモロジーを検索するために ...
https://www.jst.go.jp > minicourses > blast-tutorial - 配列データベースとホモロジー検索
Defaultの設定ではアミノ酸の場合は3文字,塩. 基配列は27文字. 一致する部分を検索. 一致したワードを両方向に伸ばし、HSP (high score segment pair)を求める。
https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp > lectures - I.構造編-11.データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ
この方法は「相同性(ホモロジー)検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列(クエリー配列といいます)と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
https://www.cosmobio.co.jp > technology > milk-protein-12 - 遺伝子解析ツール集:ホモロジーサーチ - 研究留学ネット
... ホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。以前はギャップを考慮しなかったためアミノ酸配列のホモロジー検索ではFASTAを使う人も多かったが ...
http://www.kenkyuu.net > genetool-03 - BLASTクイックスタート
tblastnではアミノ酸配列を入力とし、核酸データベースに対して検索が可能です。この際データベース側は6フレームすべてをアミノ酸に変換し、アミノ酸 vs アミノ酸の検索が ...
https://www.jst.go.jp > nbdc > bird > minicourses > blast - 相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ
BLASTでは,アミノ酸配列の比較の場合には,BLOSUM62というアミノ酸の間の相同性スコア行列を利用します。DNAの塩基配列の場合は,一致した塩基には+5,異なる ...
https://www.ddbj.nig.ac.jp > activities > blast-doc - 第5節 データベースおよびウェブツールを用いた バイオ ...
このよ. うに、ホモロジー検索は、単に類似する配列の検索のみならず、遺伝子の進化・系統学的解析やタ. ンパク質の機能予測など様々な解析に用いられる。ここでは、 ...
https://ocw.kyoto-u.ac.jp > uploads > 2012/04 > 201... - blastp | アミノ酸配列のホモロジー検索 - 生命情報科学
... 相同性を持つアミノ酸配列をデータベースから検索するプログラムである。blastp は塩基配列には対応しておらず、塩基配列に対して相同性検索を行う場合は blastn を使う。
https://bi.biopapyrus.jp > seq > blast > blastp