配列モチーフ探索 - Heavy Watal

  1. https://heavywatal.github.io
  2. bio
  3. motif
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見つけ方 · 1ゲノムの中で共発現してる遺伝子のプロモーターを集めて高頻度な部分配列を探す · 複数種のorthologousな遺伝子のプロモーターを集めて特に保存的な部分配列を ...


モチーフ検索

  1. https://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp
  2. ~shimizu
  3. bio
  4. motif
  1. https://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp
  2. ~shimizu
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保存された配列から共通のモチーフを見つけ出すことでタンパク質間での機能の類似を見つけだし、未知のタンパク質の機能や機能部位を推定することができます。 例えば、 ...


配列モチーフを探す STREME - macでインフォマティクス - はてなブログ

  1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
  2. entry
  3. 2020/12/17
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  3. 2020/12/17

2020/12/17 -STREMEは、選択した停止基準を満たすまで、以下の5つのステップを繰り返してモチーフを検索する。停止基準は、モチーフの統計的有意性（p値）、または ...


配列モチーフ・隠れマルコフモデル

PDF
  1. http://goto.kuicr.kyoto-u.ac.jp
  2. lecture
  3. 5_motif
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  1. http://goto.kuicr.kyoto-u.ac.jp
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  3. 5_motif

配列アライメント. データベースサーチ. タンパク質機能・立体構造予測. 配列モチーフ・隠れマルコフモデル. メタゲノム解析（緒方）. 分子進化・分子系統解析（緒方）.


配列モチーフ解析 - ゲノム解析ツール リンク集 - Tool - NBDC

  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
  3. view
  4. stga_tool
  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
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  4. stga_tool

モチーフ検索サーバー。 アミノ酸配列に関してはProfilefindによるプロファイル検索とHmmpfamによるHMM検索が可能である。DBとしてはPROSITE Pattern、Skip entries with ...


モチーフについて - J-Stage

  1. https://www.jstage.jst.go.jp
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  3. jjsai
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共通の先祖を持つ DNA配列やアミノ酸配列に共. 通に見られるモチーフを「配列モチーフ」と呼ぶ． ... 配列を検索する． ホモロジー検索は，検索結果の評価 ... の探索を行う．


課題5．モチーフ検索（MOTIF, Pfam）

  1. https://www.kanehisa.jp
  2. Japanese
  3. lect
  4. prob05
  1. https://www.kanehisa.jp
  2. Japanese
  3. lect
  4. prob05

ヒトのアポトーシス関連遺伝子 BCL2 のアミノ酸配列中にどんなモチーフがあるか、MOTIF および Pfam で検索する。 手順：MOTIF. DBGET でアミノ酸配列データベース ...


Biosequence: モチーフ検索 - Orbit Intelligence

  1. https://intelligence.help.questel.com
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  3. articles
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配列をモチーフで検索できます。 CDR配列の基、特定のペプチドパターン、またはSNPの検索がこれまでになく簡単になりました。 Motif の書き方ルール.


モチーフ配列検索の実行 - CAS.org

  1. https://www.cas.org
  2. performing-a-motif-sequence-search
  1. https://www.cas.org
  2. performing-a-motif-sequence-search

本ビデオでは、CAS SciFinderでのモチーフ検索の実行方法を解説します。


モチーフ抽出 - ゲノム解析ツール リンク集 - Tool - NBDC

  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
  3. view
  4. stga_tool
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ゲノム配列上の調節配列に関する解析サーバー。指定した遺伝子の上流配列を取得する機能、パターン抽出機能、パターン検索機能およびアノテーションの可視化機能を提供する ...