配列データベースとホモロジー検索
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◇少量の鋳型DNAでも,塩基配列を決定できる. 7 ... ホモロジー検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を ... これらと相同なアミノ酸配列がMgenitalium.faa内に ...
2. アミノ酸配列解析
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NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
NCBI BLASTチュートリアル
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tblastn. アミノ酸配列を問い合わせ配列として、塩基配列データベースを6フレームでアミノ酸に翻訳しながら相同. 性を持つ配列(エントリ)を検索します。 tblastx. 塩基 ...
生物配列解析基礎
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2021/4/7 -配列データベースとホモロジー検索 ... ▫ どのようにして,塩基配列を読むのか? 生物配列 = 塩基配列、およびアミノ酸配列 ... ▫ 一番上が最も相同性の ...
用語集
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アミノ酸配列及び塩基配列のデータベースには ... 一次配列はアミノ酸配列、二次構造はアミノ酸配列がつくる局所 ... 例えばアミノ酸配列間のホモロジー (相同性) をいう ...
I.構造編-11.データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ
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この方法は「相同性(ホモロジー)検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列(クエリー配列といいます)と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
ホモロジーサーチ
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... アミノ酸配列,DNA の塩基配列にも使用されるようになっている. 相同なアミノ酸配列をならべると似ている度合いが良く分かる(図1).ただし進化の過程で起こった ...
第5節 データベースおよびウェブツールを用いた バイオ ...
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【概 要】 『Entrez』は、上記の学術文献データベースと各種の分子生物学データベース(DNA、. アミノ酸配列、タンパク質立体構造など)を統合したものであり、米国 NLM の ...
相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ
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バイオインフォマティクス
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▫ アミノ酸配列の場合,進化過程における相対的な置換. のしやすさを反映. ▫ 塩基(DNA)配列の場合,マッチ+1,アンマッチ0と. いった簡単なスコア. ② 信頼できる ...