BLAST ホモロジーサーチ で検索した結果 1〜10件目 / 約4,320件 - 0.36秒
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- NCBI BLASTチュートリアル
大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。 次に中央部の青四角で囲んだ部分が、 ...
https://www.jst.go.jp > minicourses > blast-tutorial - 遺伝子解析ツール集:ホモロジーサーチ - 研究留学ネット
BLASTが登場するまではホモロジー検索の代名詞であったが、いまでは、使用頻度は低くなっている。しかし、いまでもアミノ酸配列のホモロジー検索には好んでFASTAを使って ...
http://www.kenkyuu.net > genetool-03 - バイオインフォマティクスの基礎実習(ホモロジー検索)
デフォルトでは、BLASTの検索結果はE-valueの小さい順に並べられ、E-valueが10を超えるものは表示されない。 クエリ配列と検索された配列のアラインメントは、検索結果 ...
https://lecture.ecc.u-tokyo.ac.jp > database > lec2 - BLAST: Basic Local Alignment Search Tool
The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to ...
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov - 配列データベースとホモロジー検索
BLAST検索の際にE valueの閾値を設定することで,その値. よりも小さいE valueの検索結果しか出力されなくなります. 閾値を設定するには,-evalueオプションを用います.
https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp > lectures - BLASTクイックスタート
その後、blastボタンを押してホモロジー検索を実行します。 しばらく待つと結果が表示されます。極めて多くのヒットが認められます。トップヒットのアライメントを見て ...
https://www.jst.go.jp > nbdc > bird > minicourses > blast - 相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ
ここでは,BLASTのプログラムの原理と実際の作業手順について,簡単に紹介します。 何を探すのか. 最初に,相同性(homology)の概念について解説します。単に相同性と ...
https://www.ddbj.nig.ac.jp > activities > blast-doc - 2. アミノ酸配列解析
NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp > bioinfo > section_02 - ホモロジーサーチ
BLAST はまず,質問配列と比較した時にある値 T 以上のスコアを持つ長さ k 文字の全てのパターンを生成し,そのリストを作成する.その後これらのリストにあるパターンを ...
http://www.igs.cnrs-mrs.fr > ogata2 > Paper - BLASTとコンパチブルで高速なホモロジー検索ツール Diamond
2017/8/24
-Diamondはindexのつけ方を工夫することでBLASTXの解析速度を加速できるツール。blastと同等の機能を持つが、論文ではblastより最大20000倍高速化 ...
https://kazumaxneo.hatenablog.com > entry > 2017/08/24