配列データベースとホモロジー検索
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ホモロジー検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で,進化・系統分類の解析,機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...
NCBI BLASTチュートリアル
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... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。
Smith-Waterman法は データベース中のすべての配列との間で忠実にアラインメントを行なってホモロジースコアを算定する。BLASTやFASTAで見落とすような弱い類似性も拾える ...
2. アミノ酸配列解析
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NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
ホモロジー検索 | NITE - NBRC Culture Catalogue - 製品評価技術基盤機構
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検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER
BLASTクイックスタート
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このミニコースでは、配列相同性検索プログラムであるBLASTファミリについて実用的な紹介をしていきます。その課題は単純な探索から、ある特別な目的の探索をBLASTの ...
I.構造編-11.データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ
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この方法は「相同性(ホモロジー)検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列(クエリー配列といいます)と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
GENESEQ, PATGENE ファイル - ホモロジー検索 (BLAST, GETSIM ...
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2022/2/14 -GENESEQ ファイルは、世界 57 ヵ国の特許から抽出した核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです。
ホモロジーサーチとは何? わかりやすく解説 Weblio辞書
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生物情報学(バイオインフォマティクス)や、ゲノム科学などで使われる解析手法で、一定のアルゴリズムに基づき、異なる分子間のアミノ酸配列やヌクレオチド配列の類似性に ...
第5節 データベースおよびウェブツールを用いた バイオ ...
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5.4 ホモロジー検索. 【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、. データベース中にあるかどうかを調べることである ...