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GEO ID(基本は"GSE"のID)で取得可能なcurated datasetsをinSilicoDbというRパッケージで取得するやり方を示します。 しかし、運よく存在すればいいのですが、not available ...

2014/7/18 -GSEは、失われたデータの存在下で多変量場所と散乱を推定します。 RSKCは、Robust Sparse K-means Custeringを提供します。 堅牢な混合物判別分析 ...

2022/12/13 -GSE: Robust Estimation in the Presence of Cellwise and Casewise Contamination and Missing Data. Robust Estimation of Multivariate Location ...

2023/8/27 -GSEAとはGene Set Enrichment Analysisの略です。任意の二群間比較における遺伝子発現差を入力とし、累積分布関数を用いて、エンリッチメントスコアと ...

2017/12/16 -RPubs. by RStudio. Sign in Register. Dr. Bonoの生命科学データ解析 : 2章 ... GSEから始まるID:ひと実験のまとまり ex.GSE74377; GSMから始まる ...

2015/3/5 -但し、GSEから始まるIDは受. け付けないので、SRPから ... gmt. 機能解析の出力は、825個の遺伝子. セットごとに計算された統計量(p値や. FDR値)である。

2023/3/1 -GSE(Gene Set Enrichment)解析は、ゲノムスケールの実験から生物学的な知見を引き出すために重要な役割を担っている。

2019/11/11 -RにはGene Ontology (GO)解析やGene Set Enrichment Analysis (GSEA)を行うためのパッケージがいくつもあります. 「どのパッケージを選んだらいいのか ...

2022/7/26 -公共のRNA−seqデータを探したいけど、いろんなデータベース(DB)があってどこを探せばよいのかわからない…などの経験は少なからずありますよね。今回はAOE ...

2019/1/16 -発現解析の論文でよく使われるGSEA(外部サイトにリンクします)は「二群間で発現が異なる遺伝子が特定の遺伝子セットに偏っているかどうか」を調べる手法 ...