SWISS-MODEL Repositoryで立体構造モデルをダウンロードする

  1. https://www.altif-labs.com
  2. site
  3. how-to-swissmodel1
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  3. how-to-swissmodel1

ダウンロードしたモデル構造のPDBファイルには、二次構造がアサインされていません。 リボンモデル等で表示するには、二次構造のアサインを行います。


立体構造データベースと その利用 - 東京大学

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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. lectures
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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
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2018/4/19 -– PDB ID：数字1文字と英数字3文字からなる、各 ... 「Actions」→「Ribbon」→「hide」でこれらの残基のリボン ... 構造決定の方法を記入せよ. • PowerPoint ...


分子置換モデル - おうちでできる構造解析

  1. https://ouchidekaiseki.com
  2. o06_model
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  2. o06_model

SWISS-MODELのAutomated Modeをクリック · 配列とE-mailアドレスを入力して "Submit Modeling Request" をクリック。 型となる分子(pdbファイル)を指定することもできます。


3－1－2 タンパク質の3次元構造を観る

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  1. https://www.sci.gakushuin.ac.jp
  2. units
  3. upfiles
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欲しい構造の PDB ID が分から. ない場合は，とりあえず名前の簡易検索結果を構造解析の分解能で並べ替えて上から（高分. 解能側から）見ていくのも一つの方法です ...


バイオインフォマティクス基礎講座 分子系統解析とタンパク質立体構造 ...

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  1. https://www.jst.go.jp
  2. jinzai
  3. literacy
  4. streaming
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2009/9/12 -主にリボン図の描画用のソフト。GUIを持たず、コマン. ドラインで、PDBファイルをPSファイル等に変換。 Swiss PDB. Viewer au.expasy.org/spdbv Win Mac.


FAQ - 日本蛋白質構造データバンク

  1. https://pdbj.org
  2. help
  3. faq
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2-4) UniProt ID（Swiss-Prot ID）から、その ... リボンモデルに追加して表示する方法を教えて下さい ... 6-2) jV: 構造データのPDBファイルがRasMacで認識できません。


タンパク質立体構造をPDBjViewerで表示しよう - Chem-Station (ケムステ)

  1. https://www.chem-station.com
  2. blog
  3. 2012/04
  4. post-376
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2012/4/19 -わたしは、いつもRCSB PDBを使っているので、こちらで使い方を説明させていただきます。 まず「PDB」でグーグル検索しましょう。PDBjもRCSB PDBも上位に ...


Ribbons - Swiss PDB Viewer

  1. https://spdbv.unil.ch
  2. ribbon
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  2. ribbon

By default it is a wireframe ribbon representation of five parallel strands, but you can change the number of strands to be used (up to 21) in the Ribbons ...


生体高分子の立体構造とその予測

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  1. http://isw3.naist.jp
  2. LECDOC_KINDAI
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  1. http://isw3.naist.jp
  2. LECDOC_KINDAI

2007/5/22 -Swiss PDB. Viewer. OpenGLを用いた質の高い描画 ... リボン. 分子表面. 1. 2. 3. 4. Page 5. • 分子機能の理解 ... 立体構造アライメントの ...


タンパク質分子の分子模型及びその作製方法 - Google Patents

  1. https://patents.google.com
  2. patent
  1. https://patents.google.com
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ここで、「リボンモデル」とはタンパク質のα−へリックスやβ−シート構造の主鎖部分をらせん型や直線状のリボンとして表示するモデルを指し、「ネオンモデル」とは ...