HMMERはワシントン大学で開発されたHMM（Hidden Markov Model：隠れマルコフモデル）を利用して特徴の抽出と検索を行うシステムです。PVMやthreadを用いた並列処理に対応する ...
MOTIF Search. Search Motif Library, Search Sequence Database · Generate Profile · KEGG2 · Help. Enter query sequence: (in one of the three forms). Sequence ID
課題5．モチーフ検索（MOTIF, Pfam）. ヒトのアポトーシス関連遺伝子 BCL2 のアミノ酸配列中にどんなモチーフがあるか、MOTIF および Pfam で検索する。
モチーフ検索サーバー。 アミノ酸配列に関してはProfilefindによるプロファイル検索とHmmpfamによるHMM検索が可能である。DBとしてはPROSITE Pattern、Skip entries with ...
配列をモチーフで検索できます。 CDR配列の基、特定のペプチドパターン、またはSNPの検索がこれまでになく簡単になりました。 Motif の書き方ルール.
2020/12/17 -STREMEは、選択した停止基準を満たすまで、以下の5つのステップを繰り返してモチーフを検索する。停止基準は、モチーフの統計的有意性（p値）、または ...
指定されたモチーフファイルに記述されたシーケンスモチーフを検索します。 モチーフ検索は、核酸・アミノ酸配列検索向けにつくられたパターン検索です。
ユーザの入力したアミノ酸配列中にあるPRINTSのモチーフを検索するツールである。PRINTSはアミノ酸モチーフデータベースの一つ。FingerPRINTScanは検索結果として一致した ...
モチーフ検索、. ドメイン・. ファミリー検索. 配列類似性検索. パターンマッチング ... • モチーフ検索、二次構造予測、翻訳後修飾予測、相互作用部位予測. • 柔軟な ...
次世代シーケンスデータを使用して、ゲノム上のリピートモチーフを検索します。ゲノムサイズの大きな動植物でも、少量のリードデータからリピートモチーフを検索する ...