NCBI GEOの使い方1 〜マイクロアレイデータの検索・取得
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2017/1/2 -今回は、まずGEOの検索インターフェースを使って、自分の興味のあるマイクロアレイ実験データセットにたどり着く方法およびその生データのダウンロード ...
DNAマイクロアレイのシグナル強度とは？ - Learning at the Bench
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2020/7/1 -サマライゼーションを経たもので、測定された生データそのものではなく、いくつかの仮定をもとに補正されたものになります。そのため、シグナル強度は数値 ...
マイクロアレイの正規化手法とデータの解釈について | Subio Platform
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このケースのように、生データの分布の形が違う場合でも強制的に形を揃えるためにQuantile Normalizationなど強力な正規化手法が開発されました。 RMA (Fig1)はQuantile ...
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マイクロアレイデータの解析例 1.3 （散布図、正規化の影響）
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2015/1/8 -よく見ると、rawデータと、正規化後のデータでは、（ratio で判定した場合）変動ありと判定される遺伝子に異なる部分があることがわかります。特に ...
マイクロアレイの受託解析を利用する際に知っておきたいポイント
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2017/9/4 -手元に専用の解析ソフトがある場合、生データを入手できていれば自分たちの手で解析を行うことができます。しばらく時間が経ってから、新しい条件で解析を ...
Raw data | ArrayExpress - EMBL-EBI
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Raw data files can be downloaded individually from the “Samples and Data” page in the rightmost column (Figure 15). For microarray experiments, a zipped ...
Accepted Data File Formats - DDBJ - 国立遺伝学研究所
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- datafile
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マイクロアレイデータファイル形式. 生データファイルの形式. アッセイ毎の生データファイル (推奨):. マイクロアレイスキャナー付属ソフトによって生成される “native” ...
マイクロアレイデータの解析例 1.2 （ボックスプロット、正規化）
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2015/1/7 -raw データのボックスプロット. raw データ（正規化前）の散布図を示します。便宜上、サンプルの名前を、293T_16hr_Control = control1, ...
マイクロアレイとはどのような技術？原理や解析方法、活用例 - 3D-Gene
- https://www.3d-gene.com
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2021/12/22 -読み取った蛍光強度を数値化し、その値（生データ）を正規化して比較解析することにより、サンプルに含まれる数多くのRNAの発現量を網羅的に把握すること ...
Accepted raw microarray files formats - Annotare < EMBL-EBI
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Raw (recommended): The "native" files generated by the microarray scanner software. Make sure you do not change/edit the native files in any way, and submit one ...