配列データベースとホモロジー検索
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ホモロジー検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で ... ホモロジー検索による比較ゲノム. Mpneumoniae.faaには,Mycoplasma pneumoniaeが ...
NCBI BLASTチュートリアル
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... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。
Smith-Waterman法は データベース中のすべての配列との間で忠実にアラインメントを行なってホモロジースコアを算定する。BLASTやFASTAで見落とすような弱い類似性も拾える ...
HomoloGeneを用いた相同な遺伝子の検索 | TogoTV
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2015/7/14 -NCBIが提供するHomoloGeneは、真核生物間の相同的な遺伝子を検索するツールです。種間比較や系統樹作成のために、興味のある相同遺伝子を一括で取得 ...
第5節 データベースおよびウェブツールを用いた バイオ ...
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- 2012/04
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5.4 ホモロジー検索. 【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、. データベース中にあるかどうかを調べることである。
ホモロジー検索 (by BLAST) - NBRC Culture Catalogue - NITE
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- HomologyDispSearchServlet
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検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER
Ensembl チュートリアル
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- Ensembl1
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NCBI MapViewerのようにゲノムベースでその上にアノテーションされている遺伝子などの情報を閲覧すると共に、ホモロジー検索 ... 遺伝子名に検索キーワードが含まれている ...
I.構造編-11.データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ
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- milk-protein-12
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この方法は「相同性(ホモロジー)検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列(クエリー配列といいます)と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
2023/10/18 -取得した塩基配列(もしくはアミノ酸配列)と相同性のある配列(似た配列)を検索したいときによく使用されるのが、BLAST(Basic Local Alignment Sarch ...
ホモログ及びオルソログタンパク質を検索するwebデータベース orthoFind
- https://kazumaxneo.hatenablog.com
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- 2019/06/02
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2019/6/2 -ホモログを検索するとき、最初の選択は通常相同性検索のための標準的なツール、BLAST [ref.5]である。しかし、ホモログと見なされるすべての配列を収集し ...
Q.同じ遺伝子を動物種間で比較するのがホモロジーですよね? 何%の相同性があるか知りたいんですが、Blastnでその数値は確認できますか? たとえば、トカゲなんかの遺伝子配列をマウスなどと比較すると...
解決済み-回答:1件-2019/11/13
Q.某大学でバイオテクノロジーについて学んでいます そこで質問なんですが、 ホモロジー検索について謝ってるものはどれかという問題で、 1.ホモロジーが高ければ、共通の祖先遺伝子に由来する可能性が高い 2
解決済み-回答:1件-2016/11/21
Q.来週、進級のかかったテストがあります。実習のテストなんですがどんな問題が出るか見当がつきません。生徒などに教えてる側の人にできればアドバイスもらいたいです。 実習の内容なんですが分子生物の実習で...
解決済み-回答:1件-2007/10/20