Jalviewを使って配列解析・系統樹解析をする - TogoTV
- https://togotv.dbcls.jp
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2022/5/20 -Jalviewは多重アラインメントの結果から分子系統樹を作成することができるビューワー/エディターです。今回は、MacにインストールしたJalviewを使用し ...
webで動作する高速で軽量な分子系統樹可視化ツール IcyTree
- https://kazumaxneo.hatenablog.com
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- 2018/10/09
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- 2018/10/09
2018/10/9 -webで動作する高速で軽量な分子系統樹可視化ツール IcyTree ... 系統樹の可視化は、計算系統学(computational phylogenetics)の極めて重要な側面である。
web上でマルチプルアライメントを実行し分子系統樹を出力する ...
- https://kazumaxneo.hatenablog.com
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- 2018/07/20
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2018/7/20 -Multiple sequence alignment (MSA)は、biological sequencesの比較分析において重要なステップである。著者らは、MAFFT [論文より ref.1、2]を使用 ...
オンラインで使用可能な系統樹ツール「Interactive Tree Of Life (iTOL)」
- https://www.tegakari.net
- 生物学・農学
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iTOL annotation editor を通してスプレッドシートからツリーにアクセスし、新しいデータセットの作成や、既存データセットの編集、色の範囲の定義やツリーラベルの更新 ...
おすすめサイト - 北海道大学 農学部
- http://lab.agr.hokudai.ac.jp
- spinach
- Spinach_link
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MacユーザーがGUI環境でLocal Blast解析する場合は、GenoemMatcher を使うことをお勧めします。 導入から基本操作まで · 配列入手から系統樹作成まで · 制限酵素切断地図の ...
解析ソフトウェア - 岩崎貴也のページ - Google Sites
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org/~tryphon/populations/)集団系統樹作成ソフトウェア。コマンドラインで操作。NJ treeとUPGMAが可能。遺伝子座と個体についてブートストラップが可能。遺伝距離も ...
aLeavesとMAFFTを使ってアミノ酸配列収集と系統樹推定を行う
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2014/2/28 -aLeavesは、 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター ゲノム資源解析ユニットが提供する、分子系統解析のためのツールです。ある1つのアミノ酸 ...
Interactive Tree Of Life (iTOL) | オンライン 使用可能 系統樹 ツール
- https://www.unipos.net
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系統樹等の表示、アノテーション、管理のためのオンラインツール。 ブラウザ上で直接、ツリーの管理や可視化ができ、またそれらを様々なデータセットで注釈付けすることが ...
バイオインフォマティクス解析ソフト:Geneious Prime ラーニング
- https://www.mdf-soft.com
- geneious
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Geneious Primeの操作方法を説明した動画をご覧頂けます。「系統樹の作成」「BLAST検索」「De Novoアセンブリ」「RNA-Seq データを使った発現解析」など、動画を通して ...
系統樹を作成する [ゲノム解析ツール リンク集 - How-to] - NBDC
- http://togodb.biosciencedbc.jp
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ClastalのWEBサイトにアクセスします。入力データとなる配列群をペーストするかアップロードの設定を行います。マルチプルアライメントに使用されるパラメータを設定する ...