配列データベースとホモロジー検索
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ホモロジー検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で,進化・系統分類の解析,機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...
Smith-Waterman法は データベース中のすべての配列との間で忠実にアラインメントを行なってホモロジースコアを算定する。BLASTやFASTAで見落とすような弱い類似性も拾える ...
ホモロジーサーチとは何? わかりやすく解説 Weblio辞書
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- ホモロジーサーチ
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生物情報学(バイオインフォマティクス)や、ゲノム科学などで使われる解析手法で、一定のアルゴリズムに基づき、異なる分子間のアミノ酸配列やヌクレオチド配列の類似性に ...
ホモロ. ジーサーチとは,問い合わせ配列とデータベースに蓄積. されたすべての配列を比較することによって,問い合わ. せ配列と類似性をもつ配列を検索することである.では.
ホモロジーサーチ
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ホモロジーサーチとはデータベースの中に自分が持っている配列と似ている配列がないかと検索することで,その結果, 運よく似た配列が見つかり,その配列の構造や機能 ...
NCBI BLASTチュートリアル
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... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。
第5節 データベースおよびウェブツールを用いた バイオ ...
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【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、. データベース中にあるかどうかを調べることである。遺伝子 A と高い相同性 ...
2. アミノ酸配列解析
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NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
I.構造編-11.データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ
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この方法は「相同性(ホモロジー)検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列(クエリー配列といいます)と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ
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最初に,相同性(homology)の概念について解説します。単に相同性と言っても,様々です。2本の配列を比較したときに,連続した5個のアミノ酸のみが完全 ...