配列データベースとホモロジー検索
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ホモロジー検索は,配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で,進化・系統分類の解析,機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...
NCBI BLASTチュートリアル
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... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。
Smith-Waterman法は データベース中のすべての配列との間で忠実にアラインメントを行なってホモロジースコアを算定する。BLASTやFASTAで見落とすような弱い類似性も拾える ...
2. アミノ酸配列解析
- https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
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- section_02
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NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
HomoloGeneを用いた相同な遺伝子の検索 | TogoTV
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2015/7/14 -NCBIが提供するHomoloGeneは、真核生物間の相同的な遺伝子を検索するツールです。種間比較や系統樹作成のために、興味のある相同遺伝子を一括で取得 ...
BLASTとコンパチブルで高速なホモロジー検索ツール Diamond
- https://kazumaxneo.hatenablog.com
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- 2017/08/24
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2017/8/24 -BLASTとコンパチブルで高速なホモロジー検索ツール Diamond ... Diamondはindexのつけ方を工夫することでBLASTXの解析速度を加速できるツール。blastと同等 ...
ホモロジー検索 (by BLAST) - NBRC Culture Catalogue - NITE
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検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER
I.構造編-11.データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ
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この方法は「相同性(ホモロジー)検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列(クエリー配列といいます)と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...
ホモロジーサーチとは何? わかりやすく解説 Weblio辞書
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- ホモロジーサーチ
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生物情報学(バイオインフォマティクス)や、ゲノム科学などで使われる解析手法で、一定のアルゴリズムに基づき、異なる分子間のアミノ酸配列やヌクレオチド配列の類似性に ...
GENESEQ, PATGENE ファイル - ホモロジー検索 (BLAST, GETSIM ...
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2022/2/14 -GENESEQ ファイルは、世界 57 ヵ国の特許から抽出した核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです。
Q.ホモトキシコロジーを電話診察・処方してくれる動物病院を探してます、どなたかご存じないでしょうか? 愛猫が慢性腎不全と診断されました、全然気が付かず、まさかの思いです。ネット検索して、ホモトキシコ...
解決済み-回答:3件-2013/8/25
Q.同じ遺伝子を動物種間で比較するのがホモロジーですよね? 何%の相同性があるか知りたいんですが、Blastnでその数値は確認できますか? たとえば、トカゲなんかの遺伝子配列をマウスなどと比較すると...
解決済み-回答:1件-2019/11/13
解決済み-回答:2件-2007/6/1