配列データベースとホモロジー検索

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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
  2. lectures
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  1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
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ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...


遺伝子解析ツール集：ホモロジーサーチ - 研究留学ネット

  1. http://www.kenkyuu.net
  2. genetool-03

... ホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。以前はギャップを考慮しなかったためアミノ酸配列のホモロジー検索ではFASTAを使う人も多かったが ...


NCBI BLASTチュートリアル

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  1. https://www.jst.go.jp
  2. minicourses
  3. blast-tutorial
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  1. https://www.jst.go.jp
  2. minicourses
  3. blast-tutorial

... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。


in silico biology, com - 相同性検索 - インシリコバイオロジー

  1. https://www.insilico-biology.com
  2. homology-srch-fmn-ja
  1. https://www.insilico-biology.com
  2. homology-srch-fmn-ja

検索を実行するには以下の方法があります。 クエリー配列 を直接入力する方法. メインメニュー -> Genome Analysis > Homology Search > Homology Search by Direct Input ...


相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ

  1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
  2. activities
  3. blast-doc
  1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
  2. activities
  3. blast-doc

最初に，相同性（homology）の概念について解説します。単に相同性と言っても，様々です。2本の配列を比較したときに，連続した5個のアミノ酸のみが完全 ...


ホモロジー検索 (by BLAST) - NBRC Culture Catalogue - NITE

  1. https://www.nite.go.jp
  2. HomologyDispSearchServlet
  1. https://www.nite.go.jp
  2. HomologyDispSearchServlet

検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER


ホモロジー検索 - ゲノム解析ツール リンク集 - Tool - NBDC

  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
  3. view
  4. stga_tool
  1. https://togodb.biosciencedbc.jp
  2. togodb
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  4. stga_tool

日立中央研究所によって開発された高感度なホモロジー検索ツールである。 これらのツールは、動的に核酸配列をアミノ酸配列に変換して、厳密な動的プログラミング法に ...


BLASTとコンパチブルで高速なホモロジー検索ツール Diamond

  1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
  2. entry
  3. 2017/08/24
  1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
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  3. 2017/08/24

2017/8/24 -BLASTとコンパチブルで高速なホモロジー検索ツール Diamond ... Diamondはindexのつけ方を工夫することでBLASTXの解析速度を加速できるツール。blastと同等 ...


BLAST: Basic Local Alignment Search Tool - NCBI

  1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov
  2. blast
  1. https://www.ncbi.nlm.nih.gov
  2. blast

BLAST finds regions of similarity between biological sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates ...

Nucleotide BLAST-Blastx-Frequently Asked Questions-Protein BLAST


ホモロジーサーチ

  1. http://www.igs.cnrs-mrs.fr
  2. ogata2
  3. Paper
  1. http://www.igs.cnrs-mrs.fr
  2. ogata2
  3. Paper

配列解析の基本的な手法であるホモロジーサーチがいかにして類似配列をデータベース中に検索するのか， 本稿ではその利用法も含めて紹介する． 【キーワード】 ゲノム計画 ...