「九州新幹線 遅延-みずほ609号は、山形新幹線でカモシカと衝突の影響で、遅れが出ています。」とか恐ろしい...

其の辺に関してだけは北陸新幹線を新大阪に延伸した際にリニアとの対面乗換と共に山陽新幹線の直通を考えてる（山陽新幹線をリニア対面乗換する副産物でしょうけど）構想有るので小浜ルートでも出て来る問題かと。まぁ米原よりは対象し易いかもですが。

つるぎの遅延は他の北陸新幹線の列車に大きな影響がないではないか？

いや、いざ米原ルートで全通となった時は金沢や敦賀折り返しがメインになりそうなはくたかやかがやきより、全て米原（かその先）が起点になるつるぎや新列車（仮称：らいちょう）の方が大きな影響を与えうるのでは……？