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ご紹介有難う御座います Shannonの情報理論を中心に基礎を解説し複雑系科学への応用を概説した総説 fMRI等でdataを情報として捉え評価するため必要な基礎が分かり易く纏められている 情報理論は不確実性の基での推論の数学であり複雑系model化に有用 #information_thory #complex_system #papers

leafs@leafs_s_jp

Information Theory for Complex Systems Scientists arxiv.org/abs/2304.12482

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血管周囲腔(PVS)拡大のGWASを行い細胞外Matrix/膜輸送に関わる24個の遺伝子座を同定 PVSは脳小血管病の早期biomarker PVS拡大には遺伝的な要因が関与し特に発生期の血管-脳実質間interactionが重要 高血圧はPVS拡大の原因 PVS拡大は脳卒中の原因 OA #PVS #SVD #papers doi.org/10.1038/s41591… pic.twitter.com/URhxM1hcSg

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成人早期MRI NODDI marker関連新規遺伝risk座を同定 最も強固な関連は既知のWMH遺伝子座VCANとNDI WMH容積の遺伝的感受性は若年成人のNDIの低下と関連 これらはcSVDの早期メカニズムと再髄鞘化/神経発生/神経変性に関連するプロセスを示唆 OA #NODDI #GWAS #papers doi.org/10.1038/s41380… pic.twitter.com/0kgJz5Cthh

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Awake miceの大脳皮質における0.1Hzの血管運動が血流に与える影響と時空間的dynamics ・血管運動は進行波を形成し安静時と刺激誘発活動時で皮質灌流を調節 ・穿通動脈での進行波はICSを混合するが移動のdriving forceにはならず #microcirculation #glymphatics #papers doi.org/10.1016/j.neur… pic.twitter.com/xYhzw1pVRZ

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ストレスに対するレジリエンスの神経生物学的基盤に関する総説 前臨床研究からレジリエンスが積極的なプロセスであり分子/細胞/回路レベルのメカニズムが解明されつつある レジリエンスをキーワードにストレス反応に対する働きが俯瞰できる #stress #resilience #papers doi.org/10.1016/j.neur… pic.twitter.com/Fnn1t1PIQU

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【dynDTIlow-b】 心拍同期血管周囲DWI 血管拡張によって誘発された血管周囲CSF(pCSF)の軸方向および半径方向の拡散係数と白質の平均拡散係数の増加は、動脈脈動がヒトの脳におけるpCSFの流れを加速する OA #PVS #glymphatics #papers doi.org/10.1016/j.neur… pic.twitter.com/Pn8NqSIAzm

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ご紹介有難う御座います ヒト脳の脂質地図 脂質組成は脳領域間で大きく異なりミエリン含量や細胞タイプなどの構造的特徴だけでなく機能的結合性や情報処理階層性とも関連 脳脂質が構造と機能を橋渡しする分子基盤となっている可能性 OA #lipid #connectivity #papers x.com/leafs_s/status… pic.twitter.com/VX7jtVWqj8

CLaE@leafs_s

Nature Communications Lipidome atlas of the adult human brain nature.com/articles/s4146…

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fMRIおよびwide-field calcium imaging(WFCI)を用いmouseのconnection base ID(個体識別)を行う 両モダリティでIDが可能でありWFCIがより高いID率と細胞特異的な情報を示した 👇software(ヒトへの応用も可) bioimagesuiteweb.github.io/webapp/ #connectome_based_ID #fMRI #papers doi.org/10.1101/2024.0… pic.twitter.com/beCt09bddJ

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Microgliaと活性化因子Trem2の神経変性疾患への役割 Microglia活性化状態は単純なM1/M2分類を超えて複雑であり疾患関連microgliaなど特異的subtypeが存在 Trem2はAβなどのclearanceに重要な役割を果たすが調節異常は慢性炎症を引き起こす OA #Trem2 #Alzheimers #papers doi.org/10.1177/107385… pic.twitter.com/Ka1Kv1tZsc

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Energy Landscape解析(ELA)で抽出されたrsfMRIの「覚醒安静時」脳活動の動的特徴はdataの線形かつ定常的な統計的性質で大部分が説明可能 3種類の線形/定常modelを適用し実dataの統計的性質を保持した擬似dataを生成し実dataとELAを比較 #energy_landscape #fMRI #papers doi.org/10.1101/2024.0… pic.twitter.com/Yo6r3hnOuv

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ご紹介有難う御座います Long Read Sequencingを使った胎生期ヒト新皮質の全長転写産物解析にて72.6%が新規isoform RNA結合蛋白質(RBP)により制御される細胞型特異的isoform switchが神経発生に関与し発現patternが神経発達/精神疾患のRiskに寄与 #development #genomics #papers pic.twitter.com/Bo1I0eW09t

CLaE@leafs_s

Science Developmental isoform diversity in the human neocortex informs neuropsychiatric risk mechanisms science.org/doi/10.1126/sc…

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Alzheimer病/tauopathy脳に特徴的なアスパラギン酸421(Asp421)で切断されたtauの除去は脳組織tau減少と認知障害改善を示す Asp421に対するmonoclonal抗体5G2の1回投与は脳間質液中tau濃度を46%減少 13週間投与後、不溶性tau蛋白質59-74%除去 #tau #Alzheimers #papers doi.org/10.1101/2024.0… pic.twitter.com/FvWv8YFiNn

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MRI data(T1WI, DTI)から機械学習を用い神経細胞/シナプス密度を予測 神経細胞/シナプス密度mapは参照基準と高いhistogram一致度 一方空間相関は低く個別化された予測を示唆 Energy代謝が専門のYaleのProf.Hyderらの報告 #neuronal_density #synaptic_density #papers doi.org/10.1093/cercor…

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抑制性neuronのmitochondriaは興奮性neuronよりも多く酸化的燐酸化(oxphos)でsynapse機能を維持する能力が高い TMEM65がNCLXへのallosteric modulationを通しmitochondria Ca2+の細胞質への放出を亢進させる事がsynapse能力維持に重要 #mitochondria #EI_balance #papers doi.org/10.1101/2024.0… pic.twitter.com/GeVxVbX4Lc

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#papers #AMBERLEAF #シャグ  最近この中辺りに半円の切り目入ってるペーパー下段の方にほぼ全部あるんやけどなんなん アンバーリーフの付属ペーパー100枚入ってるから半分は使えるけどさぁ なんか毎回下段やから製造で不具合出てんやない? pic.twitter.com/6hiAoan5wY

sijime@sijime2

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アストロサイト-ニューロン乳酸シャトル(ANLSH)への反証 乳酸がglucoseの代替energy基質として高energy需要の神経network rhythmに於て効率が低く潜在的に有害である可能性 高Lac/Glucose比は中枢性疲労/認知障害/てんかん発作に寄与する可能性 #ANLSH #lactate #papers doi.org/10.1111/jnc.15… pic.twitter.com/OefNCNZQkA

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脳疾患に共通の遺伝子プロファイル 神経変性疾患、精神神経疾患、神経発達障害の3カテゴリーにまたがる7つの神経疾患についてメタ解析 31遺伝子が共通変動しておりextra celluller matrix(ECM) 経路/成長因子/酸性化学物質応答/封入構造に集簇 #ECM #aging #papers doi.org/10.1101/2024.0… pic.twitter.com/OZDc7vtumi

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脳に於ける乳酸の代謝と働き ・代謝基質/情報伝達分子の両方として機能 ・Astrocyteの好気的解糖によって産生されNeuronやOligodendrocyteに供給されenergy要求を支える ・神経保護/血管新生/神経新生/抗炎症応答を促進するsignal伝達を司る #lactate #signaling #papers doi.org/10.1212/WNL.00… pic.twitter.com/YBcJIqoE2i

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慢性的カフェイン摂取はパーキンソン病(iPD)の線条体dopamine transporer結合能を低下させiPDの発症riskを低下 カフェインによる線条体DAT結合能低下はdopamine神経終末保護/dopamine神経毒性軽減等を介しiPDのriskを低下させる可能性 OA #Parkinson #caffeine #papers doi.org/10.1002/ana.26… pic.twitter.com/KZavRyQ3gt

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脳エネルギー代謝:今後の研究ロードマップ 脳のエネルギー代謝の複雑性と、神経伝達のエネルギー供給/代謝物輸送/シグナル処理/老化と疾患における代謝機能不全など、様々な側面での未解決問題を概説 OA #energy_metabolism #glutamate #papers doi.org/10.1111/jnc.16… pic.twitter.com/yO3fW09oHk

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効率AAV vectorを用いたin vivo Perturb-seqにより、脳発生過程の遺伝子制御networkを単一細胞levelで解明 transpozon systemとの組み合わせにより6%以上の細胞を標識可能 Foxg1の撹乱は第6層に特異的に影響し細胞運命決定に重要 OA #Perturb_seq #development #papers doi.org/10.1016/j.cell… pic.twitter.com/qRcs30QeMa

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ADとSVDは白質微細構造に対し空間的に異なる影響を及ぼす 大脳辺縁系経路は主にAD病理とAPOE-e4の影響 交連線維/連合線維/投射線維はcSVD負荷と心血管riskに関連 AD病理とcSVDの相互作用は認められない OA #DTI #Alzheimers #papers doi.org/10.1002/acn3.5… pic.twitter.com/A5saZPlRv2

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Conditional Tau KO mouseによる研究 ・興奮性neuronに於けるtau選択的低下はglobalなtau低下の保護効果と同様 ・抑制性neuronに於けるtau選択的低下はてんかん感受性を増加 ・成体全脳でのtau低下は発達期のtau欠損と同様の保護効果 #tau #Alzheimers #papers doi.org/10.1101/2024.0… pic.twitter.com/8OMCyhLB2x

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CTAでの虚血巣内spot signは出血性梗塞を予測する可能性がある OA #ischemia #stroke #papers doi.org/10.1002/ana.26… pic.twitter.com/Fnwwh3sVXJ

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Parkinson病の臨床的多様性を説明する為導入された病理起源がbrain-firstとbody-firstの2つのsubtypeを仮定したα-syn起源部位とconnectome model(SOCM)についての総説 brain-firstは症状左右差が大きく嗅覚低下/自律神経症状が軽度でRBD発症が遅い #iPD #symptom #papers doi.org/10.1016/j.park… pic.twitter.com/9EpMff54sH

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Alzheimer病におけるE/I balance障害と治療戦略 Alzheimer病症例死後脳と5xFADmiceの解析から、GBAAR、KCC2、NKCC1の発現/活性変化によるE/I balanceの乱れが示された mTORC1阻害剤やKCC2/NKCC1を標的とする薬剤が治療に有望である可能性 #EI_balance #Alzheimrs #papers doi.org/10.1093/brain/…

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FLVCR2はBBBの主要なCholine Transporterであり内向きH+勾配を利用し脳内へCholineを取り込む 変異体解析とCryo-EMから芳香族/Ion性AAがCholinを協調的に結合する分子機構を解明 FLVCR2は脳の発生・機能に必須であり変異は胎生致死 #choline #MRS #papers doi.org/10.1038/s41586… pic.twitter.com/X0aLtaAPZn

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スパースコーディングの意味 miceのBarrel皮質における両側ヒゲ識別課題遂行中のtwo photon Ca imagingとtargeted two-photon optogeneticsを用いsparce codingの機構的基盤を検証 皮質2/3層ではnon-coding neuron光刺激は知覚biasを誘発 #sparse_coding #papers doi.org/10.1016/j.neur… pic.twitter.com/UF7iHXWIt5

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脳の老化と介入戦略 神経炎症/境界構造の機能低下/概日リズムの乱れ等の複合原因がそれぞれの脳細胞の機能障害を生じ疾患を招くメカニズムと介入戦略について詳細に述べた総説 脳老化と中枢免疫、それに対する対策を俯瞰するには最適 #aging #inflammation #papers doi.org/10.1016/j.tins… pic.twitter.com/aahaedBvyZ

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Suspected non-AD pathophysiology (SNAP)についての総説 SNAPはAβ正常、tau/神経変性異常を示す不均一な概念で認知機能正常者や軽度認知障害で一般的 AD/PART/LATE等の病理を反映、MCI-SNAPはAD riskが高い APOE ε4の頻度は低い #SNAP #Alzheimers #papers doi.org/10.1038/s41582… pic.twitter.com/LCE6b0HJr2

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AAVベクターを用いて脳室上衣細胞からAPOE2を発現させることでAPP/PS1/APOE4マウスのAD病理が用量依存的に改善 APOE2はAPOE4の発現量を変えずにAβ沈着/神経炎症/synapse消失を軽減 Aβ沈着減少を介した間接的な効果でmicroglia反応性低下 OA #ApoE #Alzheimers #papers doi.org/10.1016/j.ymth… pic.twitter.com/qD581C5Sya

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情動記憶のengramが形成され睡眠によって調節される機構を分子/synapse/神経回路/行動から考察した総説 睡眠は記憶痕跡の選択的な強化と再構成を通し情動記憶を適応的に処理 睡眠不足や睡眠障害はこれを妨げ精神疾患のriskを高める可能性 #emotion #sleep #papers doi.org/10.1038/s41583… pic.twitter.com/9Fi3PM3CNP

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脳内分子移動は主に受動的な拡散で睡眠や麻酔で変化しないがclearanceは睡眠/麻酔で低下というglymphatic仮説と相反する結果 Mouse脳で自由拡散する小色素AF488の拡散と動態を光学的に測定 Photobleachを用いた結果は受動的拡散という報告が多い OA #glymphatics #papers doi.org/10.1038/s41593… pic.twitter.com/n2ouW6VnKX

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幼少期の低gradeの全身性炎症は高gradeの全身性炎症による影響とは逆に閾値以下の脳炎症を誘発しCSF1R経路によって駆動されるmicrogliaの増殖を促進する 炎症が繰り返されるとDAMが出現 繰り返しによるAD miceのAβ⇧/認知機能⇩ OA #inflammation #Alzheimer #papers doi.org/10.1002/glia.2…

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ご紹介有難う御座います ヒト側頭葉の1mm^3の脳組織をEMで撮影し5万7千個の細胞と1億5千万個のsynapseからなる神経回路を1.4Pbyteの超大規模dataに再構築 glia数はneuronの2倍 深層neuronは樹状突起の向きで分類可能 1neuronは数千の弱いsynapse入力/数十の強力なsynapse入力を受ける #EM #papers pic.twitter.com/04THIk6n5B

CLaE@leafs_s

Science A petavoxel fragment of human cerebral cortex reconstructed at nanoscale resolution science.org/doi/10.1126/sc…

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ヒトの海馬におけるTG-PACがWorking Memory保持と制御を調整 θ位相とγ振幅の非線形相互作用に選択的応答するPAC neuronは前頭葉の制御信号を統合しworking memory表現の質を向上させ保持を支援 PAC neuronはcategory neuronと重複せず #woking_memory #TG_PAC #papers doi.org/10.1038/s41586… pic.twitter.com/4qfETY7XxR

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Wilson-Cowanのneural mass modelを全脳に用いAlzheimer病におけるAβとtauの蓄積が神経活動に与える影響を個人levelで評価 病期の進行に伴い神経興奮性が増加し血漿biomarker濃度の上昇/灰白質萎縮の加速/認知機能障害と関連 OA #Alzheimers #neural_mass_model #papers doi.org/10.1038/s42003… pic.twitter.com/IBjCIZx3fC

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Alzheimer病(AD)におけるCholesterol代謝の障害について基礎から最新の知見を纏めた総説 過剰な神経細胞内cholesterolが老人斑/tangleの形成に関与しAPOE遺伝子多型やCYP46A1の機能低下がAD脳でのcholesterol蓄積の原因となる #cholesterol #Alzheimers #papers doi.org/10.1093/brain/… pic.twitter.com/37AgjmpDc7

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