※多量体の表面電荷を計算するときは、あらかじめPDBファイルを編集し単量体にする必要があります。 計算自体はできますが、正しい電荷を計算することができません。
2011/9/27 -アミノ酸配列から二次構造を予測する．最初にPDBに類似配列が存在しないかを調べてくれる．その後類似配列を配列データベースから検索し，すべての配列に ...
タンパク質分子表面形状と物性のデータベースeF-site による分子機能類似性検索 ... 静電ポテンシャルのタンパク質表面での値を, ＋ 0.1V 以. 上は青, −0.1V 以下は赤 ...
2012/4/19 -• タンパク質立体構造データベース. – 検索. – データのダウンロード. • 立体構造データの可視化. • 立体構造データフォーマット. • 配列データベースとの ...
タンパク質の分子量、等電点、αへリックス含有率、疎水性・新水性表面積、ファンデルワールス体積、総電荷、ゼータ電位、疎水性／正電荷／負電荷の表面パッチの表面積等の ...
eF-site （エフサイト）は蛋白質の機能部位に関する電子表面形状を見るためのデータベースです。活性部位のコノリー表面（Connolly surface）上に静電ポテンシャルと ...
2016/8/25 -タンパク質などの生体分子が機能を発揮する上で、アミノ酸や金属イオンの電荷状態は大きな影響を及ぼすため、電荷情報は非常に重要です。 今回、研究 ...
分子表面の計算サーバ. PDB formatのファイルを受け付ける. eF-siteと同じ条件で分子表面及び静電ポテン. シャルを計算する. 結果を見るためのURLをメールで通知. Page ...
2009/9/12 -※DNAやRNAなどの核酸は、リン酸基にマイナスの電荷を持っている。よって、核酸に. 結合する蛋白質は表面にプラスの電荷を持っているものが多い。 平成 ...
その結果，ポリマー分子中の酸素原子あるいは水酸基. が，タンパク質分子表面の解離基および極性基と静電 ... タンパク質のデータベースや解析ツール. 5.