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2011/9/27 -アミノ酸配列から二次構造を予測する．最初にPDBに類似配列が存在しないかを調べてくれる．その後類似配列を配列データベースから検索し，すべての配列に ...
タンパク質の分子量、等電点、αへリックス含有率、疎水性・新水性表面積、ファンデルワールス体積、総電荷、ゼータ電位、疎水性／正電荷／負電荷の表面パッチの表面積等の ...
2012/4/19 -• タンパク質立体構造データベース. – 検索. – データのダウンロード. • 立体構造データの可視化. • 立体構造データフォーマット. • 配列データベースとの ...
タンパク質分子表面形状と物性のデータベースeF-site による分子機能類似性検索 ... 静電ポテンシャルのタンパク質表面での値を, ＋ 0.1V 以. 上は青, −0.1V 以下は赤 ...
2012/7/13 -2011-08-30RCSB PDB (Protein Data Bank)は、タンパク質の立体構造データベースです。立体構造のデータは、タンパク質を構成する原子の座標データとして ...
その結果，ポリマー分子中の酸素原子あるいは水酸基. が，タンパク質分子表面の解離基および極性基と静電 ... タンパク質のデータベースや解析ツール. 5.
2009/9/12 -※DNAやRNAなどの核酸は、リン酸基にマイナスの電荷を持っている。よって、核酸に. 結合する蛋白質は表面にプラスの電荷を持っているものが多い。 平成 ...
PyMOLのプラグインでデフォルトでインストールされているAPBSを使って表面電荷を表示してくれる方法を説明します。 このプラグインは、インストーラー版を使ってPyMOL 2を ...
タンパク質表面上の疎水性領域、正電荷領域、負電荷領域を検出、可視化します。さらに各領域を2次元. 投影し、タンパク質間の表面パッチ特性の差異を見やすく描画します。
またタンパク質データベースに対して、表面パッチの数や表面積を連続計算できます。 image. 抗体CNT0607の野生型（上）と変異体（下）における表面パッチ解析。負電荷表面 ...