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NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...
続いてアミノ酸配列同士の配列比較時の検索エンジンを設定しましょう。アミノ酸配列同士の比較では通常blastp. が用いられますが、よい弱いホモロジーを検索するために ...
データベース検索（ホモロジー検索）. ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした.
BLAST ☆ NCBI · DDBJ · GenomeNet. 他の方法に比べて桁違いに高速であるBLAST法はホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。
以上の操作で得られたラクトフェリンのアミノ酸配列データと似た配列を持つタンパク質が他にあるかどうかを検索してみます。この方法は「相同性（ホモロジー）検索」と ...
tblastn クエリー配列がアミノ酸で、検索対象データベースが塩基配列の時に利用するプログラムである。検索する際に、核酸データベースは一度アミノ酸配列 ...
ヒューリスティックなローカルアライメント法に基づいたホモロジー検索手法。核酸、アミノ酸配列いずれも受け付け、核酸、アミノ酸配列データベースへの探索を実施する。
tblastnではアミノ酸配列を入力とし、核酸データベースに対して検索が可能です。この際データベース側は6フレームすべてをアミノ酸に変換し、アミノ酸 vs アミノ酸の検索が ...
blastp は、アミノ酸配列からなる入力配列と相同性を持つアミノ酸配列をデータベースから検索するプログラムである。blastp は塩基配列には対応しておらず、塩基配列に ...
○相同性検索に用いるサイト · 「NCBI BLAST N」 ・・・ DNA配列のホモロジー検索サイト · 「NCBI BLAST P」 ・・・ タンパク質(アミノ酸配列)のホモロジー検索サイト · の『 ...