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    • NCBI BLASTチュートリアル

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    1. https://www.jst.go.jp
    2. minicourses
    3. blast-tutorial
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    3. blast-tutorial

    BLASTは、Basic Local Alignment Search Tool の略で、ペアワイズの局所的なアライメント／相同性検索（ホモ. ロジー検索）を比較的高速に行うプログラムのことを指し ...


    配列データベースとホモロジー検索

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    1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
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    ◇少量の鋳型DNAでも，塩基配列を決定できる. 7 ... ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を ... BLAST検索の際にE valueのしきい値を設定することで ...


    BLASTクイックスタート

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    その後、blastボタンを押してホモロジー検索を実行します。 しばらく待つと結果が表示されます。極めて多くのヒットが認められます。トップヒットのアライメントを見て ...


    相同性検索プログラムBLASTの内部構造 - DDBJ

    1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
    2. activities
    3. blast-doc
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    BLASTでは，アミノ酸配列の比較の場合には，BLOSUM62というアミノ酸の間の相同性スコア行列を利用します。DNAの塩基配列の場合は，一致した塩基には＋5，異なる塩基に ...


    2. アミノ酸配列解析

    1. https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
    2. bioinfo
    3. section_02
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    2. bioinfo
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    NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...


    FASTAとBLASTについて - DDBJ - 国立遺伝学研究所

    1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
    2. activities
    3. homology-doc
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    ホモロジーサーチは検索者が指定したDNAや蛋白の配列に近いものをデータベースの中から捜し出すという作業です。配列がぴったし一致するなら、UNIXのgrepや宮沢さんの作っ ...


    情報処理演習（バイオインフォマティクス入門）

    1. https://www.cc.kochi-u.ac.jp
    2. ~tatataa
    3. info
    4. BLAST
    1. https://www.cc.kochi-u.ac.jp
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    4. BLAST

    ... 検索するソフトが BLASTX です。 (1) BLAST によるホモロジー検索 さて，いよいよ検索です。 検索するためには，自分の配列を BLAST による検索の画面に入力しなければ ...


    NCBIを用いた相同性検索

    1. https://www.ipc.shimane-u.ac.jp
    2. plant
    3. protocol
    4. NCBI
    1. https://www.ipc.shimane-u.ac.jp
    2. plant
    3. protocol
    4. NCBI

    「NCBI BLAST N」 ・・・ DNA配列のホモロジー検索サイト(N:nucleotide). 「NCBI BLAST P」 ・・・ タンパク質(アミノ酸配列)のホモロジー検索サイト(P:protein). 1 ...


    生物配列解析基礎

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    1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
    2. lectures
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    1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
    2. lectures

    2021/4/7 -大量の質問配列についてBLAST検索を行いたい. 自分の持っている未公開のデータに対して検索したい. ホモロジー検索を用いて比較ゲノム解析を行いたい.


    遺伝子解析ツール集：ホモロジーサーチ - 研究留学ネット

    1. http://www.kenkyuu.net
    2. genetool-03

    Translated BLAST Searches（自動的にアミノ酸に翻訳してホモロジー検索を行う。blanstx、tblastn、tblastxがある。） Search for conserbed domains（アミノ酸ドメイン ...