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2023/6/20 -NCBI ftp siteよりRefseqのbacteria 16s rRNAのBlast DBをダウンロード; blastdbcmdにてBlast DB形式からfastaへ; Taxonkit, csvtkを使って、単一階級から複数階級の情報 ...

2024/4/14 -AWS ParallelCluster で BLAST を実行する場合、コンピュートノードで必要になるセットアップと、どのようなワークロードなのか事前に把握したく EC2 で動かしてみました。

2024/3/28 -従来の local BLAST (legacy blast と呼ばれる) を発展させたものです． ... ダウンロードファイルに .pkg がない場合もあるよう ... blastn を比較したら、以下の結果でした。

2023/11/9 -MEGANが起動したら、「File」→「Import From BLAST」からBLAST結果を開きます。 4．ダイアログ右上のボタンをクリックして、BLASTの結果ファイルを選択し、「Open」を ...

2024/2/28 -... 結果と、transcriptごと、遺伝子ごとの発現定量の結果をダウンロードすることができます。本動画では、公共遺伝子発現データベース目次 All of gene expression (AOE) ...

2023/9/20 -Contig配列をクエリにしてBlast N解析をした結果です。 ・Report 菌株ごとの解析結果について、まとめたレポートです。 データのダウンロードは結果通知メールのリンク ...

2023/5/13 -Blast結果の変換 -> 結合 -> 変換 : qza -> tsv ... BLAST検索ができるclassify-consensus-blastが提供されています。 ... •••のマークからダウンロードして以下に説明する ...

2023/10/30 -今回は、Macのターミナルを使用してRNA-seq解析に必要なデータのダウンロード方法と、fastqファイルの作成までを紹介します。 ... 結果発現量に差が大きいとされた上位の ...

2023/5/16 -右端の列のSRA Assemblyをクリックすると、アセンブルされた転写産物のGTFファイルをダウンロードできる。 ... 結果の例 ... 他にもBLAST機能やゲノムブラウザが利用できる。

2023/9/20 -ご利用しやすいファイルにてデータのご確認をお願いいたします。 結果は1か月以内にダウンロードをお願いいたします。納品から1か月経過しますとデータを削除いたします。