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    • 遺伝子解析ツール集：ホモロジーサーチ - 研究留学ネット

    1. http://www.kenkyuu.net
    2. genetool-03

    Smith-Waterman法は データベース中のすべての配列との間で忠実にアラインメントを行なってホモロジースコアを算定する。BLASTやFASTAで見落とすような弱い類似性も拾える ...


    配列データベースとホモロジー検索

    PDF
    1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
    2. lectures
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    1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
    2. lectures

    ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...


    ホモロジーサーチ

    1. http://www.igs.cnrs-mrs.fr
    2. ogata2
    3. Paper
    1. http://www.igs.cnrs-mrs.fr
    2. ogata2
    3. Paper

    ホモロジーサーチとはデータベースの中に自分が持っている配列と似ている配列がないかと検索することで，その結果， 運よく似た配列が見つかり，その配列の構造や機能 ...


    実践的ホモロジー サーチと遺伝子機能 アノテーション - J-Stage

    1. https://www.jstage.jst.go.jp
    2. article
    3. _pdf
    4. -char

    ホモロ. ジーサーチとは,問い合わせ配列とデータベースに蓄積. されたすべての配列を比較することによって,問い合わ. せ配列と類似性をもつ配列を検索することである.では.


    ホモロジー検索 (by BLAST) - NBRC Culture Catalogue - NITE

    1. https://www.nite.go.jp
    2. HomologyDispSearchServlet
    1. https://www.nite.go.jp
    2. HomologyDispSearchServlet

    検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER


    NCBI BLASTチュートリアル

    PDF
    1. https://www.jst.go.jp
    2. minicourses
    3. blast-tutorial
    PDF
    1. https://www.jst.go.jp
    2. minicourses
    3. blast-tutorial

    ... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。


    BLASTとコンパチブルで高速なホモロジー検索ツール Diamond

    1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
    2. entry
    3. 2017/08/24
    1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
    2. entry
    3. 2017/08/24

    2017/8/24 -Diamondはindexのつけ方を工夫することでBLASTXの解析速度を加速できるツール。blastと同等の機能を持つが、論文ではblastより最大20000倍高速化 ...


    FASTAとBLASTについて - DDBJ - 国立遺伝学研究所

    1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
    2. activities
    3. homology-doc
    1. https://www.ddbj.nig.ac.jp
    2. activities
    3. homology-doc

    ホモロジーサーチは検索者が指定したDNAや蛋白の配列に近いものをデータベースの中から捜し出すという作業です。配列がぴったし一致するなら、UNIXのgrepや宮沢さんの作っ ...


    GENESEQ, PATGENE ファイル - ホモロジー検索 (BLAST, GETSIM ...

    1. https://www.jaici.or.jp
    2. news
    3. products
    1. https://www.jaici.or.jp
    2. news
    3. products

    2022/2/14 -GENESEQ ファイルは、世界 57 ヵ国の特許から抽出した核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです。


    2. アミノ酸配列解析

    1. https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
    2. bioinfo
    3. section_02
    1. https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
    2. bioinfo
    3. section_02

    NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...