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    • 配列データベースとホモロジー検索

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    1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
    2. lectures
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    1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
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    ホモロジー検索は，配列の類似性から類縁の遺伝子・タンパク質を. 検索する方法で，進化・系統分類の解析，機能解析などを目的とした. 配列解析の最も基本的な手法の一つで ...


    NCBI BLASTチュートリアル

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    1. https://www.jst.go.jp
    2. minicourses
    3. blast-tutorial
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    1. https://www.jst.go.jp
    2. minicourses
    3. blast-tutorial

    ... 検索ができるようになっています。大きく分けて上部の赤四角で囲んだ部分で. は、ゲノム配列決定がされた生物種に関する各種配列データへのホモロジー検索が可能です。


    遺伝子解析ツール集：ホモロジーサーチ - 研究留学ネット

    1. http://www.kenkyuu.net
    2. genetool-03

    Translated BLAST Searches（自動的にアミノ酸に翻訳してホモロジー検索を行う。blanstx、tblastn、tblastxがある。） ... がある。BLASTサービスはNCBI以外にも多くの ...


    2. アミノ酸配列解析

    1. https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
    2. bioinfo
    3. section_02
    1. https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp
    2. bioinfo
    3. section_02

    NCBIのblastpではホモロジー検索を行うと同時にその蛋白質のドメイン構造に関する情報も得ることができ、大変便利である。ここでは大腸菌のDNAポリメラーゼIの配列を例に ...


    BLASTとコンパチブルで高速なホモロジー検索ツール Diamond

    1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
    2. entry
    3. 2017/08/24
    1. https://kazumaxneo.hatenablog.com
    2. entry
    3. 2017/08/24

    2017/8/24 -Diamondはindexのつけ方を工夫することでBLASTXの解析速度を加速できるツール。blastと同等の機能を持つが、論文ではblastより最大20000倍高速化 ...


    第5節 データベースおよびウェブツールを用いた バイオ ...

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    1. https://ocw.kyoto-u.ac.jp
    2. uploads
    3. 2012/04
    4. 201...
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    1. https://ocw.kyoto-u.ac.jp
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    3. 2012/04
    4. 201...

    5.4 ホモロジー検索. 【概 要】 ホモロジー(相同性)検索とは、ある一つの配列(たとえば遺伝子 A)と類似する配列が、. データベース中にあるかどうかを調べることである ...


    BLASTクイックスタート

    1. https://www.jst.go.jp
    2. nbdc
    3. bird
    4. minicourses
    5. blast
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    2. nbdc
    3. bird
    4. minicourses
    5. blast

    このミニコースでは、配列相同性検索プログラムであるBLASTファミリについて実用的な紹介をしていきます。その課題は単純な探索から、ある特別な目的の探索をBLASTの ...


    ホモロジー検索 (by BLAST) - NBRC Culture Catalogue - NITE

    1. https://www.nite.go.jp
    2. HomologyDispSearchServlet
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    検索シーケンス. ※シングルFASTA配列のみ検索可能です。 検索結果一覧の表示数. アラインメント表示数. 期待値 (E-value). その他 オプション, FILTER


    I．構造編-11．データベースでアミノ酸配列を検索 - コスモ・バイオ

    1. https://www.cosmobio.co.jp
    2. technology
    3. milk-protein-12
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    この方法は「相同性（ホモロジー）検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列（クエリー配列といいます）と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索でき ...


    GENESEQ, PATGENE ファイル - ホモロジー検索 (BLAST, GETSIM ...

    1. https://www.jaici.or.jp
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    2022/2/14 -GENESEQ ファイルは、世界 57 ヵ国の特許から抽出した核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです。