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  • 最終更新日：1年以内

    • BLAST: Basic Local Alignment Search Tool

    https://blast.ncbi.nlm.nih.gov
    https://blast.ncbi.nlm.nih.gov

    2023/11/28 -The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to ...


    情報処理演習（バイオインフォマティクス入門）

    1. https://www.cc.kochi-u.ac.jp
    2. ~tatataa
    3. info
    4. BLAST
    1. https://www.cc.kochi-u.ac.jp
    2. ~tatataa
    3. info
    4. BLAST

    2023/7/31 -... 検索するソフトが BLASTX です。 (1) BLAST によるホモロジー検索 さて，いよいよ検索です。 検索するためには，自分の配列を BLAST による検索の画面に入力しなければ ...


    Web連携テキスト バイオインフォマティクス

    1. http://park.itc.u-tokyo.ac.jp
    2. textbook
    3. chapter3

    2023/9/4 -リンク先は「相同性」です。調べたい配列(塩基配列またはアミノ酸配列)が共通の祖先に由来するかどうかを調べることです。ホモロジー検索ともよばれます。

    核酸・タンパク質配列<b>検索</b> - YouTubeの画像

    核酸・タンパク質配列検索 - YouTube

    1. https://www.youtube.com
    2. watch

    対象 : CAS STNext 入門、CA 文献検索、化学物質検索を受講済みの方0:00:00 はじめに0:00:53 STN の配列検索0:07:20 GENESEQ ホモロジー検索0:34:14 REGISTRY BLAST 検索 ...

    YouTube-JAICIチャンネル


    ③配列を比較したいとき - 遺伝子配列の検索や比較に役立つwebツール ...

    1. https://guides.lib.kyushu-u.ac.jp
    2. alignment

    2023/10/18 -取得した塩基配列(もしくはアミノ酸配列)と相同性のある配列（似た配列）を検索したいときによく使用されるのが、BLAST(Basic Local Alignment Sarch Tool)です。


    生物遺伝資源の情報提供 | バイオテクノロジー | 製品評価技術基盤機構

    1. https://www.nite.go.jp
    2. nbrc
    3. genome
    1. https://www.nite.go.jp
    2. nbrc
    3. genome

    2024/3/27 -ゲノム配列情報から微生物の機能を推定するデータベース、 MiFuPを公開しています。 こちらから、目的の機能を持つと推定される微生物を手軽に検索できます。 データベース ...


    シークエンスアラインメント - ベクタービルダー

    1. https://www.vectorbuilder.jp
    2. tool
    3. sequence-alignment
    1. https://www.vectorbuilder.jp
    2. tool
    3. sequence-alignment

    2023/7/29 -2つの異なる種のDNAをアラインメントすることで、より相同性の高い領域や選択圧の高い領域を特定することができます。タンパク質の配列を、よく解析されたタンパク質の配列 ...


    in silico biology, com - 機能と操作 - インシリコバイオロジー

    1. https://www.insilico-biology.com
    2. solution-menu-ja
    1. https://www.insilico-biology.com
    2. solution-menu-ja

    2023/11/1 -キーワード検索 · パターン検索 · 相同性検索 · バッチ（一括）ホモロジー検索.


    Local BLAST 検索 - GENETYX Ver.17 機能説明

    1. https://www.genetyx.co.jp
    2. products
    3. features
    4. localblast
    1. https://www.genetyx.co.jp
    2. products
    3. features
    4. localblast

    2023/12/4 -... ホモロジー検索ソフトウェアです。 データベースのディビジョンに登録された配列に対して BLAST 検索ができます。 インターネット BLAST 検索と同様の結果を表示します。


    CAS SciFinder-n 検索ガイド 2023 年 9 月 - 化学情報協会

    PDF
    1. https://seminar.jaici.or.jp
    2. doc
    3. sfn

    2023/9/25 -CAS Sequences から配列質問式を使って検索することができます。 ・ BLAST ホモロジー検索 : 局所的に類似した配列を. 検索するプログラム. ・ CDR 配列検索 : 抗体と T ...