2023/9/4 -ホモロジー検索ともよばれます。 PSI-BLAST：Altschul et al., Nucleic Acids Res., 1997 position-specific iterated BLASTの略です。BLAST検索で ...
2023/10/18 -Blast. 取得した塩基配列(もしくはアミノ酸配列)と相同性のある配列（似た配列）を検索したいときによく使用されるのが、BLAST(Basic Local Alignment Sarch Tool)です。
対象 : CAS STNext 入門、CA 文献検索、化学物質検索を受講済みの方0:00:00 はじめに0:00:53 STN の配列検索0:07:20 GENESEQ ホモロジー検索0:34:14 REGISTRY BLAST ...
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2023/10/11 -ここからアミノ酸配列のマルチ FASTA 形式を取得することができる。 別の例として麹菌の遺伝子 AN7028.2 のホモロジー検索をして、機能割り当てをしてみよう。
2024/6/13 -GitHub - labstructbioinf/pLM-BLAST: Detection of remote homology by comparison of protein language model representations. Detection of remote homology by ...
2024/5/16 -立体構造モデリングの手法としてホモロジー・モデリング法が有用に使われている。 ... PST-BLAST (Position specific iterative BLAST）ではそういった計算を行って普通 ...
Q.ホモロジーモデリングに用いられるMODELLERプログラムについての質問です。 MODELLERプログラムはBLASTを用いていると書いてありましたが、 どのように用いているのでしょうか。 目...
A.質問がよくわからないです。 Eswar et al.のFigure 2.9.7にある２つの配列ではなく複数の配列からなるマトリクスファイルと比較するということでしょうか。 ひとつひとつ、チュー...
Q.某大学でバイオテクノロジーについて学んでいます そこで質問なんですが、 ホモロジー検索について謝ってるものはどれかという問題で、 1.ホモロジーが高ければ、共通の祖先遺伝子に由来する可能性が高い 2
A.hobbygogさん 誤っているのは４番です。 FASTA や BLAST は、データベースではなくホモロジー検索を行なう プログラムの名前です。 DNA やアミノ酸配列を取り扱うプログラムで、
2023/9/17 -BLASTは、Basic Local Alignment Search Toolの略です。「ぶらすと」と読みます。DNAの塩基配列あるいはタンパク質のアミノ酸配列のシーケンスアラインメントを行うための ...
2024/5/28 -全ゲノムのBatch Homology Search が99％進捗したところで停止してしまう。 · スレッド投入速度がBlast検索速度とのバランスがとれない、および異常に長い検索時間がかかる ...
2023/12/4 -BLAST 用データベース作成機能 · リファレンス配列へのマッピング機能 · ホモロジー解析 · 検索結果をマルチプルアライメント風に表示 · Local BLAST 検索 · NCBI BLAST ...
2024/3/22 -blastなどのホモロジー検索を行わないと記載されているのは、オフターゲットについては、考慮しない設計を行うということですか。 A. 通常、オフターゲットは考慮致し ...