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4日前 -カレント配列を簡単に逆相補鎖表示に切り替えることができます。塩基配列は、最後の塩基のComplementが最初の塩基になり、各フィーチャーの表示位置もすべて逆転表示され ...
2024/5/16 -立体構造の相同性検索などから基質を推定できないだろうか。 生化学：構造とゲノムの文脈を用いることによる新規な酵素と代謝経路の発見 Suwen Zhao, Ritesh Kumar ...
2024/5/15 -DNA配列決定はDNA 分子の特徴を巧みに利用しているため，前半でDNA・RNAの分子の性質を取り上げ，後半で文字列検索のアルゴリズムを紹介し，ゲノム配列を復元する方法を ...
2024/5/30 -テキスト検索だけでなく、アミノ酸配列のモチーフや、化合物、DNAやRNAとの複合体の状態等、条件を選択して検索することができます。 検索条件を追加して、複数の条件 ...
2024/6/6 -タンパク質言語モデルにより正確で高速なリモート相同性配列検索を行う PLMSearch ... 現代のDNAシーケンシング技術は、単離した生物のみならず、生物のコレクション ...
2024/5/28 -全ゲノムのBatch Homology Search が99％進捗したところで停止してしまう。 · スレッド投入速度がBlast検索速度とのバランスがとれない、および異常に長い検索時間がかかる ...
Q.来週、進級のかかったテストがあります。実習のテストなんですがどんな問題が出るか見当がつきません。生徒などに教えてる側の人にできればアドバイスもらいたいです。 実習の内容なんですが分子生物の実習で...
A.最低限押さえておくべき所だろうなぁ、と思う点をいくつか書いてみます。 ・DNA組み換えに必要な酵素とその動態、機構…制限酵素とか、DNAリガーゼとかがどう作用するか。 ・形質転換（トランスフォ...
2024/6/14 -5章：ゲノム配列情報の意味を解読する方法をいくつか紹介する。特に，ホモロジーサーチ法を解説し，その手法で広く使われているソフトウエアBLASTについて使い方も含めて ...
2024/5/10 -その結果、11種類のプロテオームについて、ホモロジーモデリングでの予測に対して、平均25%の残基を新たに高精度でモデリングし、Protein Data Bankエントリーにはほとんど ...
2024/5/2 -現代の生命科学で注目を集めているゲノム編集技術は、生物のDNA配列を特定の箇所で切断し、編集することで、遺伝的特徴を意図的に変更する手法です。
2024/5/9 -さらに、配列アラインメントとホモロジーモデルから、クエリタンパク質の相互作用界面の残基を推測することができる。毎週更新されるPPI3Dデータベースには、PDBにある ...