2024/3/1 -細胞の機能・表現型を整理したデータベースCell IOを構築する。ヒトやマウスなどの1細胞トランスクリプトームデータと紐づく細胞の機能・表現型と摂動情報を整理する。文献 ...
2024/7/3 -Tissue Dashboardでは、各組織サンプルの統計情報や遺伝子発現データを俯瞰的に調べることができます。特定の遺伝子（例：ACTN4）を検索すると、その組織別発現量をバイオリン ...
2024/9/9 -解析を外部に委託してしまっている… という方もいるのではないでしょうか。scRNA-seq解析は、個々の細胞レベルでの遺伝子発現を解析する革新的な技術で、その解析技術は ...
2023/10/28 -GEOの概要：GEOはNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースで研究者から提出されたマイクロアレイ、NGSなどから得られた機能ゲノミクスデータを蓄積し、 ...
2024/7/10 -... 発現量(トランスクリプトーム)データから当該組織中の細胞種の比率を準網羅的に推定するアルゴリズムを開発しました。 組織中の細胞比率は、免疫細胞の浸潤などにより ...
2024/3/25 -遺伝子網羅的な計測によりデータ駆動的に規定された個々の細胞の状態を，AIを用いて細胞画像から推定した．ロボットの開発による自動化によりデータ取得を効率化し，この ...
Q.遺伝子操作について質問です。 大学の生化学の授業で以下のようなレポート課題が出されました。目的遺伝子はグレリン（ghrelin）に選定したのですが、何をどうしたらいいのか全くわかりません。 レポ...
A.かなり大変ですね。 まずはデーターベースでghrelinの配列を調べます。NCBIのホームページでnucleotidesのところでghrelinを検索します（別のデータベースでもいいと思います）。人
2024/10/8 -ヒトに関する遺伝子、タンパク質、化合物、疾患など様々なカテゴリにおいて、8つのカテゴリー、20のデータベースに由来する65個の属性を探索することができ、検索結果を ...
2024/9/5 -2024年9月4日、京都大学医生物学研究所のVANDENBON Alexis准教授らは、空間トランスクリプトミクスデータベース 「DeepSpaceDB」を公開したことを発表しました。
2024/7/13 -細胞アノテーションは遺伝子の発現情報に基づき、データベースの細胞タイプの中から最も類似した細胞タイプを割り当てます。これには様々な方法があり、今回はdecouplerと ...
2024/8/19 -エンリッチメント解析によりDEGの機能を同定します。 解析に使用できる遺伝子セットは、以下の通りです。 MSigDB hallmark gene · KEGG · Reactome · PID (Pathway ...