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2024/3/21 -発現量とp値はそれぞれゲージを動かすことで、絞り込みを行うことができます。発現量の表とも連動しており、目的の遺伝子のみを表示したり、ラベルを付与することができ ...
2024/3/4 -Volcano plotは、横軸に遺伝子の発現比、縦軸に統計的有意性（p値）をまとめた図です。遺伝子の発現を視覚化することで、重要な変化をしている遺伝子を特定することが可能 ...
2024/4/3 -DNA解析. では全ゲノム解析によりSNV/Indel83万箇所（構造変異は約. 4万箇所）、RNA解析では網羅的発現量解析によりp値 0.05. 以下の185遺伝子座を検出しました。
2024/3/25 -3種類の培養細胞（本文参照）の300遺伝子の発現量を用いた主成分分析．クローズドサークルは各遺伝子の発現量の計測値，オープンサークルは各遺伝子の発現量の推定値を用 ...
2024/3/29 -Visualizationの特徴. 発現量の閾値を変えて、グラフを何度でも簡単に作成できます。 外れ値となるサンプルや不要な遺伝子を除いて、グラフを再作成することができます。
2024/4/15 -発現ランキングに基づくGene set enrichment analysis (GSEA)を解説する。 DEGのエンリッチメント解析では閾値次第で結果が変わることや、発現変動量の情報を失う ...
2024/3/28 -図1の減少群・増加群のタンパク質をコードする遺伝子の発現量をそれぞれヒートマップで示した。出生後、おおむね15日齢頃までに発現量の減少または増加が生じることが ...
2024/2/26 -PMA処理によってCt値が3程度小さくなっており、IL-8の発現量が有意に増大し. ていることが分かりました。（p値はStudentのt検定より算出しました）。このよう. に本製品 ...
2024/3/14 -遺伝子の機能を理解するためには、何らかの手法でその遺伝子の発現量を抑制し、抑制による影響を調べる必要があります。 ... 補正p値=0.05を破線で示している。 (B)RNA切断 ...
2024/3/18 -ボルケーノプロットはlog fold changeと発現差の統計的有意性の関係性の可視化のため、遺伝子発現解析で広く用いられます。 今回は以前の記事（下記リンク参照）で実施 ...
Q.統計初心者です。ある物質のmRNAの発現量と年齢との相関を調べている文献で「r=-0.62、P=0.10」と記載してありました。r値ってそもそもなんなのでしょうか？正直さっぱりです。教えていただけれ
A.rは相関係数です。マイナスの符号がついているので、年齢が増えるとmRNAの発現量が減る傾向があるように見えると思います。散布図を作ってみると大体の様子がわかると思います。Pは無相関の検定のp値だ...
Q.研究者でありながら、統計に疎く、どのような統計処理が適切かわかりません。 現在投稿論文にて、ある物質を処理したマウスのオス群、メス群 (各群処理後の1点でn=4ずつ)で、あるタンパク質の発現量を...
A.＞研究者でありながら、統計に疎く 特に珍しくないし，最近では，研究本体を行う人とは別に，統計データ解析をサポートする人がつく例も増えています。 実際，私もそのような依頼を，これまで，いくつも受...
Q.半保存的複製の問題 バクテリオファージの一つ、λ(ラムダ)ファージは、宿主の大腸菌に吸着すると、持っているDNAを菌体内に注入する。 注入されたDNAは、繰り返し複製を行い、約100個の子ファ...
A.結論から言うと、この問題は模範解答が間違っているように思います。 複製しても放射能の量全体は減りませんから。 実験により何が起こっているのかをまず考えます。 peaceable_nirva...