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2024/3/21 -発現量とp値はそれぞれゲージを動かすことで、絞り込みを行うことができます。発現量の表とも連動しており、目的の遺伝子のみを表示したり、ラベルを付与することができ ...
2024/1/22 -iDEPではリードカウント値の発現マトリクスを入力に用いた場合、以下の3つの発現変動遺伝子の検定手法が選択できる。基本はDESeq2を推奨している。
2024/1/18 -RNA-SeqとはRNA-Seq（リボ核酸シークエンシング）は、リボ核酸（RNA）の配列を高速に決定し、発現量を定量化するための強力な技術です。この技術は、生物の遺伝的情報 ...
2024/3/4 -Volcano plotは、横軸に遺伝子の発現比、縦軸に統計的有意性（p値）をまとめた図です。遺伝子の発現を視覚化することで、重要な変化をしている遺伝子を特定することが可能 ...
2024/4/3 -DNA解析. では全ゲノム解析によりSNV/Indel83万箇所（構造変異は約. 4万箇所）、RNA解析では網羅的発現量解析によりp値 0.05. 以下の185遺伝子座を検出しました。
2024/3/25 -3種類の培養細胞（本文参照）の300遺伝子の発現量を用いた主成分分析．クローズドサークルは各遺伝子の発現量の計測値，オープンサークルは各遺伝子の発現量の推定値を用 ...
2024/3/29 -Visualizationの特徴. 発現量の閾値を変えて、グラフを何度でも簡単に作成できます。 外れ値となるサンプルや不要な遺伝子を除いて、グラフを再作成することができます。
2023/12/11 -Volcano Plotは発現変動遺伝子の解析などで用いられる図になります。発現変動遺伝子はその発現比を用いれば何倍になったかは分かりますが、その妥当性(p値)までは ...
2023/12/12 -まずは、注目遺伝子について解釈する。 Ctrl+Fで注目遺伝子を検索して、各実験の発現量とt検定のp値を記録する。
2024/2/26 -PMA処理によってCt値が3程度小さくなっており、IL-8の発現量が有意に増大し. ていることが分かりました。（p値はStudentのt検定より算出しました）。このよう. に本製品 ...
Q.統計初心者です。ある物質のmRNAの発現量と年齢との相関を調べている文献で「r=-0.62、P=0.10」と記載してありました。r値ってそもそもなんなのでしょうか？正直さっぱりです。教えていただけれ
A.rは相関係数です。マイナスの符号がついているので、年齢が増えるとmRNAの発現量が減る傾向があるように見えると思います。散布図を作ってみると大体の様子がわかると思います。Pは無相関の検定のp値だ...
Q.研究者でありながら、統計に疎く、どのような統計処理が適切かわかりません。 現在投稿論文にて、ある物質を処理したマウスのオス群、メス群 (各群処理後の1点でn=4ずつ)で、あるタンパク質の発現量を...
A.＞研究者でありながら、統計に疎く 特に珍しくないし，最近では，研究本体を行う人とは別に，統計データ解析をサポートする人がつく例も増えています。 実際，私もそのような依頼を，これまで，いくつも受...
Q.半保存的複製の問題 バクテリオファージの一つ、λ(ラムダ)ファージは、宿主の大腸菌に吸着すると、持っているDNAを菌体内に注入する。 注入されたDNAは、繰り返し複製を行い、約100個の子ファ...
A.結論から言うと、この問題は模範解答が間違っているように思います。 複製しても放射能の量全体は減りませんから。 実験により何が起こっているのかをまず考えます。 peaceable_nirva...