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    • マイクロアレイ技術の基礎から応用までをわかりやすく解説

    1. https://minerva-clinic.or.jp
    2. ...
    3. 臨床細胞遺伝学とは

    2024/2/17 -R/Bioconductor: 統計的データ解析と生物情報学的解析に最適な、オープンソースのプログラミング言語およびソフトウェアパッケージです。マイクロアレイデータの前処理、 ...


    Google Colab で Bioconductor #ChatGPT - Qiita

    1. https://qiita.com
    2. ChatGPT

    2024/2/21 -以上の手順でBioconductorのパッケージをColabにインストールできます。これでPythonコード内からrpy2を通じてRとBioconductorパッケージを使用することが可能になります。


    生命情報解析研究室

    1. https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp
    2. ~kadota

    2023/12/15 -Rパッケージを開発してBioconductorやGitHubに置いて使えるようにしたという論文 ... (Rで)マイクロアレイデータ解析. 東京大学. 東京大学基金 · 大学院農学生命科学 ...


    RNA-seqデータの分析について勉強する -

    1. https://home.hiroshima-u.ac.jp
    2. naka
    3. wiki
    4. wiki
    5. RN...

    2024/4/15 -私の場合、RNAseq のデータをマイクロアレイのデータと同じように扱いたい。しかし Ballgown はそのようには設計されていないと書かれていた。 https://support.


    坊農 秀雅のプロフィール - tayo

    1. https://tayo.jp
    2. users

    2024/1/12 -RおよびBioconductorを使ったバイオデータ解析. 坊農秀雅. 2015年3月5日 ... マイクロアレイか?～. 坊農秀雅. 2012年11月30日. 低酸素刺激によって発現変動する遺伝子 ...


    Single sample enrichment analysis for mass spectrometry-based omics data

    PDF
    1. https://jxiv.jst.go.jp
    2. jxiv
    3. preprint
    4. download

    2023/10/28 -を採用し実際のパスウェイを取得するため R の Bioconductor パッケージ AHPathbankDbs ... GSVA: gene set variation analysis for microarray and. RNA-Seq data ...


    Methods for analyzing next-generation sequencing data ...

    1. https://www.researchgate.net
    2. publication
    3. 372050745_...

    2024/6/24 -We first describe the basic usage of RStudio, an integrated development environment for R. ... jp/~kadota/TCC/ and will appear in Bioconductor (http:// ...


    博士論文 統合的マルチオミックス解析による 肝芽腫の分子基盤の解明 ...

    PDF
    1. https://repository.dl.itc.u-tokyo.ac.jp
    2. record
    3. files

    2023/8/23 -検討するため、マイクロアレイによる網羅的 DNA メチル化解析を行った。 ... & Bock, C. LOLA: enrichment analysis for genomic region sets and regulatory elements in R ...


    togo tv - DBCLS

    1. https://togotv.dbcls.jp
    2. ...

    3日前 -RNA-seqやマイクロアレイ、ChIP-seq実験等で得られた遺伝子発現データ（リードカウントまたはFPKM）を入力として与えると、ヒートマップやPCA、発現差解析、パスウェイ解析 ...


    馬見塚 拓 - 京都大学

    1. http://rdb.kuicr.kyoto-u.ac.jp
    2. view
    3. mamitsuka

    2024/4/17 -... R/Bioconductor Package for Network Path Mining through Gene Expression. ... and Horton, P., HAMSTER: Visualizing Microarray Experiments as a Set of Minimum ...