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  • 最終更新日：1年以内

    • BLAST: Basic Local Alignment Search Tool

    https://blast.ncbi.nlm.nih.gov
    https://blast.ncbi.nlm.nih.gov

    2023/11/28 -The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to ...


    Web連携テキスト バイオインフォマティクス

    1. http://park.itc.u-tokyo.ac.jp
    2. textbook
    3. chapter3

    2023/9/4 -リンク先は「相同性」です。調べたい配列(塩基配列またはアミノ酸配列)が共通の祖先に由来するかどうかを調べることです。ホモロジー検索ともよばれます。


    情報処理演習（バイオインフォマティクス入門）

    1. https://www.cc.kochi-u.ac.jp
    2. ~tatataa
    3. info
    4. BLAST
    1. https://www.cc.kochi-u.ac.jp
    2. ~tatataa
    3. info
    4. BLAST

    2023/7/31 -... 検索するソフトが BLASTX です。 (1) BLAST によるホモロジー検索 さて，いよいよ検索です。 検索するためには，自分の配列を BLAST による検索の画面に入力しなければ ...


    ③配列を比較したいとき - 遺伝子配列の検索や比較に役立つwebツール ...

    1. https://guides.lib.kyushu-u.ac.jp
    2. alignment

    2023/10/18 -取得した塩基配列(もしくはアミノ酸配列)と相同性のある配列（似た配列）を検索したいときによく使用されるのが、BLAST(Basic Local Alignment Sarch Tool)です。


    シークエンスアラインメント - ベクタービルダー

    1. https://www.vectorbuilder.jp
    2. tool
    3. sequence-alignment
    1. https://www.vectorbuilder.jp
    2. tool
    3. sequence-alignment

    2023/7/29 -デザインサポートを依頼する · 遺伝子名からベクターを検索する ... 2つの異なる種のDNAをアラインメントすることで、より相同性 ... 品質検査証明書(COA)の検索. お知らせ ...


    生物遺伝資源の情報提供 | バイオテクノロジー | 製品評価技術基盤機構

    1. https://www.nite.go.jp
    2. nbrc
    3. genome
    1. https://www.nite.go.jp
    2. nbrc
    3. genome

    2024/3/27 -ゲノム配列情報から微生物の機能を推定するデータベース、 MiFuPを公開しています。 こちらから、目的の機能を持つと推定される微生物を手軽に検索できます。 データベース ...


    in silico biology, com - 機能と操作 - インシリコバイオロジー

    1. https://www.insilico-biology.com
    2. solution-menu-ja
    1. https://www.insilico-biology.com
    2. solution-menu-ja

    2023/11/1 -キーワード検索 · パターン検索 · 相同性検索 · バッチ（一括）ホモロジー検索.


    バイオインフォマティクス実習 資料 （清水謙多郎）

    1. https://lecture-old.ecc.u-tokyo.ac.jp
    2. ~ashimizu
    1. https://lecture-old.ecc.u-tokyo.ac.jp
    2. ~ashimizu

    2024/4/10 -GenBankを用いたホモロジー検索から、GenScanを用いた遺伝子発見、その結果とGenBankやゲノムプロジェクトのデータベースとの比較について実習する。ホモロジー検索や ...

    核酸・タンパク質配列<b>検索</b> - YouTubeの画像

    核酸・タンパク質配列検索 - YouTube

    1. https://m.youtube.com
    2. watch
    3. eclat.signalmedia.agency

    対象 : CAS STNext 入門、CA 文献検索、化学物質検索を受講済みの方0:00:00 はじめに0:00:53 STN の配列検索0:07:20 GENESEQ ホモロジー検索0:34:14 REGISTRY BLAST 検索 ...

    YouTube-JAICIチャンネル


    AlphaFold -

    1. https://home.hiroshima-u.ac.jp
    2. naka
    3. wiki
    4. wiki
    5. Alp...
    1. https://home.hiroshima-u.ac.jp
    2. naka
    3. wiki
    4. wiki
    5. Alp...

    2023/9/13 -立体構造モデリングの手法としてホモロジー・モデリング法が有用に使われている。 ... さらにプロフィールを query クエリ（問い合わせ配列データ）にしてデータベースを検索 ...